Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC5P28715 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC5P28715 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms