Protein–RNA interactions for Protein: P27344

DPB3, DNA polymerase epsilon subunit C, yeastyeast

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DPB3P27344 PHO91YNR013C 2685 nt2.6□□□□□ -1.99
DPB3P27344 SGS1YMR190C 4344 nt2.6□□□□□ -1.99
DPB3P27344 YGR018CYGR018C 330 nt2.59□□□□□ -1.99
DPB3P27344 VOA1YGR106C 798 nt2.59□□□□□ -1.99
DPB3P27344 PEX4YGR133W 552 nt2.59□□□□□ -1.99
DPB3P27344 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.59□□□□□ -1.99
DPB3P27344 LCL2YLR104W 396 nt2.59□□□□□ -1.99
DPB3P27344 VPS64YDR200C 1815 nt2.58□□□□□ -2
DPB3P27344 RUD3YOR216C 1455 nt2.58□□□□□ -2
DPB3P27344 SNX41YDR425W 1878 nt2.58□□□□□ -2
DPB3P27344 YEF3YLR249W 3135 nt2.58□□□□□ -2
DPB3P27344 YAP3YHL009C 993 nt2.58□□□□□ -2
DPB3P27344 YOR333CYOR333C 417 nt2.58□□□□□ -2
DPB3P27344 Q0017Q0017 162 nt2.58□□□□□ -2
DPB3P27344 YCR064CYCR064C 411 nt2.57□□□□□ -2
DPB3P27344 CDC50YCR094W 1176 nt2.57□□□□□ -2
DPB3P27344 RPC10YHR143W-A 213 nt2.57□□□□□ -2
DPB3P27344 RPI1YIL119C 1224 nt2.57□□□□□ -2
DPB3P27344 PKR1YMR123W 369 nt2.57□□□□□ -2
DPB3P27344 YMR324CYMR324C 243 nt2.57□□□□□ -2
DPB3P27344 DGK1YOR311C 873 nt2.57□□□□□ -2
DPB3P27344 RPB5YBR154C 648 nt2.57□□□□□ -2
DPB3P27344 SMC6YLR383W 3345 nt2.57□□□□□ -2
DPB3P27344 MSB1YOR188W 3414 nt2.56□□□□□ -2
DPB3P27344 VPS35YJL154C 2835 nt2.56□□□□□ -2
DPB3P27344 YGR045CYGR045C 363 nt2.56□□□□□ -2
DPB3P27344 YGR290WYGR290W 444 nt2.56□□□□□ -2
DPB3P27344 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.56□□□□□ -2
DPB3P27344 IRC19YLL033W 693 nt2.56□□□□□ -2
DPB3P27344 SEN15YMR059W 387 nt2.56□□□□□ -2
DPB3P27344 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt2.56□□□□□ -2
DPB3P27344 SCD5YOR329C 2619 nt2.56□□□□□ -2
DPB3P27344 RTT107YHR154W 3213 nt2.55□□□□□ -2
DPB3P27344 MZM1YDR493W 372 nt2.55□□□□□ -2
DPB3P27344 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.55□□□□□ -2
DPB3P27344 NIC96YFR002W 2520 nt2.54□□□□□ -2
DPB3P27344 UBP15YMR304W 3693 nt2.54□□□□□ -2
DPB3P27344 MTC7YEL033W 420 nt2.54□□□□□ -2
DPB3P27344 HOP2YGL033W 657 nt2.54□□□□□ -2
DPB3P27344 YNL122CYNL122C 348 nt2.54□□□□□ -2
DPB3P27344 PEX17YNL214W 600 nt2.54□□□□□ -2
DPB3P27344 RTC6YPL183W-A 282 nt2.54□□□□□ -2
DPB3P27344 SLN1YIL147C 3663 nt2.54□□□□□ -2
DPB3P27344 VPS52YDR484W 1926 nt2.53□□□□□ -2
DPB3P27344 CAJ1YER048C 1176 nt2.53□□□□□ -2
DPB3P27344 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.53□□□□□ -2
DPB3P27344 GPI15YNL038W 690 nt2.53□□□□□ -2
DPB3P27344 YJL016WYJL016W 1686 nt2.53□□□□□ -2
DPB3P27344 IRC8YJL051W 2469 nt2.52□□□□□ -2.01
DPB3P27344 MNE1YOR350C 1992 nt2.52□□□□□ -2.01
DPB3P27344 YDR286CYDR286C 345 nt2.52□□□□□ -2.01
DPB3P27344 YKL111CYKL111C 336 nt2.52□□□□□ -2.01
DPB3P27344 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.52□□□□□ -2.01
DPB3P27344 YNL010WYNL010W 726 nt2.52□□□□□ -2.01
DPB3P27344 VPH1YOR270C 2523 nt2.52□□□□□ -2.01
DPB3P27344 FKS3YMR306W 5358 nt2.52□□□□□ -2.01
DPB3P27344 IST2YBR086C 2841 nt2.52□□□□□ -2.01
DPB3P27344 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.52□□□□□ -2.01
DPB3P27344 YDL041WYDL041W 354 nt2.51□□□□□ -2.01
DPB3P27344 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt2.51□□□□□ -2.01
DPB3P27344 SMB1YER029C 591 nt2.51□□□□□ -2.01
DPB3P27344 AYR1YIL124W 894 nt2.51□□□□□ -2.01
DPB3P27344 STB4YMR019W 2850 nt2.51□□□□□ -2.01
DPB3P27344 TOF1YNL273W 3717 nt2.51□□□□□ -2.01
DPB3P27344 DNF1YER166W 4716 nt2.5□□□□□ -2.01
DPB3P27344 SPC72YAL047C 1869 nt2.5□□□□□ -2.01
DPB3P27344 YER084W-AYER084W-A 513 nt2.5□□□□□ -2.01
DPB3P27344 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.5□□□□□ -2.01
DPB3P27344 YLR053CYLR053C 327 nt2.5□□□□□ -2.01
DPB3P27344 PBI2YNL015W 228 nt2.5□□□□□ -2.01
DPB3P27344 YPL276WYPL276W 438 nt2.5□□□□□ -2.01
DPB3P27344 SIR4YDR227W 4077 nt2.5□□□□□ -2.01
DPB3P27344 SSD1YDR293C 3753 nt2.5□□□□□ -2.01
DPB3P27344 TRL1YJL087C 2484 nt2.5□□□□□ -2.01
DPB3P27344 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.49□□□□□ -2.01
DPB3P27344 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.49□□□□□ -2.01
DPB3P27344 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.49□□□□□ -2.01
DPB3P27344 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.49□□□□□ -2.01
DPB3P27344 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.49□□□□□ -2.01
DPB3P27344 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.49□□□□□ -2.01
DPB3P27344 FYV7YLR068W 456 nt2.49□□□□□ -2.01
DPB3P27344 SEC22YLR268W 645 nt2.49□□□□□ -2.01
DPB3P27344 COX7YMR256C 183 nt2.49□□□□□ -2.01
DPB3P27344 ATP19YOL077W-A 207 nt2.49□□□□□ -2.01
DPB3P27344 DAD3YBR233W-A 285 nt2.49□□□□□ -2.01
DPB3P27344 SLM6YBR266C 453 nt2.49□□□□□ -2.01
DPB3P27344 NEW1YPL226W 3591 nt2.49□□□□□ -2.01
DPB3P27344 IRC10YOL015W 1761 nt2.49□□□□□ -2.01
DPB3P27344 PDR11YIL013C 4236 nt2.48□□□□□ -2.01
DPB3P27344 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.48□□□□□ -2.01
DPB3P27344 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.48□□□□□ -2.01
DPB3P27344 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.48□□□□□ -2.01
DPB3P27344 SPC29YPL124W 762 nt2.48□□□□□ -2.01
DPB3P27344 TUS1YLR425W 3924 nt2.48□□□□□ -2.01
DPB3P27344 BNI1YNL271C 5862 nt2.48□□□□□ -2.01
DPB3P27344 TMN3YER113C 2121 nt2.48□□□□□ -2.01
DPB3P27344 DNA2YHR164C 4569 nt2.48□□□□□ -2.01
DPB3P27344 SHE9YDR393W 1371 nt2.48□□□□□ -2.01
DPB3P27344 VPS8YAL002W 3825 nt2.47□□□□□ -2.01
DPB3P27344 TOR1YJR066W 7413 nt2.47□□□□□ -2.01
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