Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX11Q9Y5W9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX11Q9Y5W9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX11Q9Y5W9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX11Q9Y5W9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX11Q9Y5W9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX11Q9Y5W9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX11Q9Y5W9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX11Q9Y5W9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX11Q9Y5W9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX11Q9Y5W9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX11Q9Y5W9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX11Q9Y5W9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX11Q9Y5W9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX11Q9Y5W9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX11Q9Y5W9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX11Q9Y5W9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX11Q9Y5W9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX11Q9Y5W9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX11Q9Y5W9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX11Q9Y5W9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX11Q9Y5W9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX11Q9Y5W9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX11Q9Y5W9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX11Q9Y5W9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX11Q9Y5W9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX11Q9Y5W9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX11Q9Y5W9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SNX11Q9Y5W9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNX11Q9Y5W9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX11Q9Y5W9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX11Q9Y5W9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX11Q9Y5W9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX11Q9Y5W9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX11Q9Y5W9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX11Q9Y5W9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX11Q9Y5W9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX11Q9Y5W9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX11Q9Y5W9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX11Q9Y5W9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX11Q9Y5W9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX11Q9Y5W9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX11Q9Y5W9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX11Q9Y5W9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX11Q9Y5W9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX11Q9Y5W9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX11Q9Y5W9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX11Q9Y5W9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX11Q9Y5W9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX11Q9Y5W9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX11Q9Y5W9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX11Q9Y5W9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX11Q9Y5W9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX11Q9Y5W9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX11Q9Y5W9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX11Q9Y5W9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX11Q9Y5W9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX11Q9Y5W9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX11Q9Y5W9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX11Q9Y5W9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX11Q9Y5W9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX11Q9Y5W9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX11Q9Y5W9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX11Q9Y5W9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX11Q9Y5W9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX11Q9Y5W9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX11Q9Y5W9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX11Q9Y5W9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX11Q9Y5W9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX11Q9Y5W9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX11Q9Y5W9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX11Q9Y5W9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX11Q9Y5W9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX11Q9Y5W9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX11Q9Y5W9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX11Q9Y5W9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX11Q9Y5W9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX11Q9Y5W9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX11Q9Y5W9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX11Q9Y5W9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX11Q9Y5W9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX11Q9Y5W9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX11Q9Y5W9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX11Q9Y5W9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX11Q9Y5W9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX11Q9Y5W9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX11Q9Y5W9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX11Q9Y5W9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX11Q9Y5W9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX11Q9Y5W9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX11Q9Y5W9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX11Q9Y5W9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX11Q9Y5W9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX11Q9Y5W9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX11Q9Y5W9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX11Q9Y5W9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX11Q9Y5W9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX11Q9Y5W9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX11Q9Y5W9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX11Q9Y5W9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms