Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y277

VDAC3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC3Q9Y277 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VDAC3Q9Y277 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VDAC3Q9Y277 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VDAC3Q9Y277 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
VDAC3Q9Y277 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
VDAC3Q9Y277 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VDAC3Q9Y277 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VDAC3Q9Y277 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VDAC3Q9Y277 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VDAC3Q9Y277 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VDAC3Q9Y277 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VDAC3Q9Y277 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VDAC3Q9Y277 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VDAC3Q9Y277 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VDAC3Q9Y277 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VDAC3Q9Y277 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
VDAC3Q9Y277 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VDAC3Q9Y277 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VDAC3Q9Y277 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VDAC3Q9Y277 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VDAC3Q9Y277 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VDAC3Q9Y277 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VDAC3Q9Y277 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VDAC3Q9Y277 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VDAC3Q9Y277 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VDAC3Q9Y277 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VDAC3Q9Y277 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VDAC3Q9Y277 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VDAC3Q9Y277 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VDAC3Q9Y277 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VDAC3Q9Y277 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VDAC3Q9Y277 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VDAC3Q9Y277 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VDAC3Q9Y277 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VDAC3Q9Y277 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VDAC3Q9Y277 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VDAC3Q9Y277 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VDAC3Q9Y277 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VDAC3Q9Y277 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VDAC3Q9Y277 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VDAC3Q9Y277 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VDAC3Q9Y277 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VDAC3Q9Y277 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VDAC3Q9Y277 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VDAC3Q9Y277 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VDAC3Q9Y277 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VDAC3Q9Y277 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VDAC3Q9Y277 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VDAC3Q9Y277 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VDAC3Q9Y277 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VDAC3Q9Y277 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VDAC3Q9Y277 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VDAC3Q9Y277 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VDAC3Q9Y277 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VDAC3Q9Y277 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VDAC3Q9Y277 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VDAC3Q9Y277 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VDAC3Q9Y277 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VDAC3Q9Y277 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VDAC3Q9Y277 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VDAC3Q9Y277 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VDAC3Q9Y277 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VDAC3Q9Y277 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VDAC3Q9Y277 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VDAC3Q9Y277 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VDAC3Q9Y277 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VDAC3Q9Y277 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VDAC3Q9Y277 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VDAC3Q9Y277 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VDAC3Q9Y277 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VDAC3Q9Y277 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VDAC3Q9Y277 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VDAC3Q9Y277 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VDAC3Q9Y277 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VDAC3Q9Y277 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VDAC3Q9Y277 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VDAC3Q9Y277 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VDAC3Q9Y277 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VDAC3Q9Y277 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VDAC3Q9Y277 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VDAC3Q9Y277 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VDAC3Q9Y277 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VDAC3Q9Y277 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VDAC3Q9Y277 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VDAC3Q9Y277 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VDAC3Q9Y277 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VDAC3Q9Y277 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VDAC3Q9Y277 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VDAC3Q9Y277 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VDAC3Q9Y277 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VDAC3Q9Y277 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VDAC3Q9Y277 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VDAC3Q9Y277 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VDAC3Q9Y277 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VDAC3Q9Y277 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VDAC3Q9Y277 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VDAC3Q9Y277 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VDAC3Q9Y277 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VDAC3Q9Y277 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VDAC3Q9Y277 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms