Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RLIMQ9NVW2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RLIMQ9NVW2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RLIMQ9NVW2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RLIMQ9NVW2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RLIMQ9NVW2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RLIMQ9NVW2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RLIMQ9NVW2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RLIMQ9NVW2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RLIMQ9NVW2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RLIMQ9NVW2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RLIMQ9NVW2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RLIMQ9NVW2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RLIMQ9NVW2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RLIMQ9NVW2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RLIMQ9NVW2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RLIMQ9NVW2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RLIMQ9NVW2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RLIMQ9NVW2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RLIMQ9NVW2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RLIMQ9NVW2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RLIMQ9NVW2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RLIMQ9NVW2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RLIMQ9NVW2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RLIMQ9NVW2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RLIMQ9NVW2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RLIMQ9NVW2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RLIMQ9NVW2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RLIMQ9NVW2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RLIMQ9NVW2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RLIMQ9NVW2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RLIMQ9NVW2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RLIMQ9NVW2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RLIMQ9NVW2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RLIMQ9NVW2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RLIMQ9NVW2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RLIMQ9NVW2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RLIMQ9NVW2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RLIMQ9NVW2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RLIMQ9NVW2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RLIMQ9NVW2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RLIMQ9NVW2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RLIMQ9NVW2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RLIMQ9NVW2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RLIMQ9NVW2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RLIMQ9NVW2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RLIMQ9NVW2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RLIMQ9NVW2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RLIMQ9NVW2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RLIMQ9NVW2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RLIMQ9NVW2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RLIMQ9NVW2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RLIMQ9NVW2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RLIMQ9NVW2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RLIMQ9NVW2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RLIMQ9NVW2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RLIMQ9NVW2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RLIMQ9NVW2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RLIMQ9NVW2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RLIMQ9NVW2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RLIMQ9NVW2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RLIMQ9NVW2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RLIMQ9NVW2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RLIMQ9NVW2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RLIMQ9NVW2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RLIMQ9NVW2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RLIMQ9NVW2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RLIMQ9NVW2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RLIMQ9NVW2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RLIMQ9NVW2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RLIMQ9NVW2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RLIMQ9NVW2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RLIMQ9NVW2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RLIMQ9NVW2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RLIMQ9NVW2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RLIMQ9NVW2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RLIMQ9NVW2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RLIMQ9NVW2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RLIMQ9NVW2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RLIMQ9NVW2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RLIMQ9NVW2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RLIMQ9NVW2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RLIMQ9NVW2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RLIMQ9NVW2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RLIMQ9NVW2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RLIMQ9NVW2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RLIMQ9NVW2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RLIMQ9NVW2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RLIMQ9NVW2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RLIMQ9NVW2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RLIMQ9NVW2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RLIMQ9NVW2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RLIMQ9NVW2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RLIMQ9NVW2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLIMQ9NVW2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLIMQ9NVW2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLIMQ9NVW2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLIMQ9NVW2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLIMQ9NVW2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLIMQ9NVW2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms