Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNBIP1Q9NSA3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNBIP1Q9NSA3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNBIP1Q9NSA3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNBIP1Q9NSA3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNBIP1Q9NSA3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNBIP1Q9NSA3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNBIP1Q9NSA3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNBIP1Q9NSA3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNBIP1Q9NSA3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNBIP1Q9NSA3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNBIP1Q9NSA3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNBIP1Q9NSA3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNBIP1Q9NSA3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CTNNBIP1Q9NSA3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CTNNBIP1Q9NSA3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNBIP1Q9NSA3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNBIP1Q9NSA3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNBIP1Q9NSA3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNBIP1Q9NSA3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNBIP1Q9NSA3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNBIP1Q9NSA3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNBIP1Q9NSA3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNBIP1Q9NSA3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNBIP1Q9NSA3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNBIP1Q9NSA3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNBIP1Q9NSA3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNBIP1Q9NSA3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNBIP1Q9NSA3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNBIP1Q9NSA3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNBIP1Q9NSA3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNBIP1Q9NSA3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNBIP1Q9NSA3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNBIP1Q9NSA3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNBIP1Q9NSA3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNBIP1Q9NSA3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNBIP1Q9NSA3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNBIP1Q9NSA3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNBIP1Q9NSA3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNBIP1Q9NSA3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNBIP1Q9NSA3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNBIP1Q9NSA3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNBIP1Q9NSA3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNBIP1Q9NSA3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTNNBIP1Q9NSA3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNBIP1Q9NSA3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNBIP1Q9NSA3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNBIP1Q9NSA3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNBIP1Q9NSA3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNBIP1Q9NSA3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNBIP1Q9NSA3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNBIP1Q9NSA3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNBIP1Q9NSA3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNBIP1Q9NSA3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNBIP1Q9NSA3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNBIP1Q9NSA3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNBIP1Q9NSA3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNBIP1Q9NSA3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNBIP1Q9NSA3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNBIP1Q9NSA3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNBIP1Q9NSA3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNBIP1Q9NSA3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNBIP1Q9NSA3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNBIP1Q9NSA3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNBIP1Q9NSA3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNBIP1Q9NSA3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNBIP1Q9NSA3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNBIP1Q9NSA3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNBIP1Q9NSA3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNBIP1Q9NSA3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNBIP1Q9NSA3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNBIP1Q9NSA3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNBIP1Q9NSA3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNBIP1Q9NSA3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNBIP1Q9NSA3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNBIP1Q9NSA3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNBIP1Q9NSA3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNBIP1Q9NSA3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms