Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF19Q9NS68 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF19Q9NS68 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF19Q9NS68 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF19Q9NS68 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF19Q9NS68 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF19Q9NS68 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF19Q9NS68 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF19Q9NS68 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF19Q9NS68 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF19Q9NS68 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF19Q9NS68 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF19Q9NS68 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF19Q9NS68 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF19Q9NS68 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF19Q9NS68 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF19Q9NS68 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF19Q9NS68 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF19Q9NS68 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF19Q9NS68 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF19Q9NS68 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF19Q9NS68 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF19Q9NS68 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF19Q9NS68 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF19Q9NS68 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF19Q9NS68 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF19Q9NS68 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFRSF19Q9NS68 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFRSF19Q9NS68 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF19Q9NS68 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF19Q9NS68 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF19Q9NS68 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF19Q9NS68 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF19Q9NS68 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF19Q9NS68 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF19Q9NS68 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF19Q9NS68 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF19Q9NS68 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF19Q9NS68 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF19Q9NS68 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF19Q9NS68 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF19Q9NS68 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF19Q9NS68 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF19Q9NS68 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF19Q9NS68 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF19Q9NS68 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF19Q9NS68 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF19Q9NS68 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF19Q9NS68 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF19Q9NS68 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF19Q9NS68 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF19Q9NS68 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF19Q9NS68 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF19Q9NS68 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF19Q9NS68 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF19Q9NS68 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF19Q9NS68 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF19Q9NS68 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF19Q9NS68 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF19Q9NS68 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF19Q9NS68 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF19Q9NS68 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF19Q9NS68 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF19Q9NS68 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF19Q9NS68 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF19Q9NS68 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF19Q9NS68 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF19Q9NS68 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF19Q9NS68 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF19Q9NS68 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF19Q9NS68 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF19Q9NS68 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNFRSF19Q9NS68 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF19Q9NS68 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF19Q9NS68 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF19Q9NS68 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF19Q9NS68 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF19Q9NS68 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF19Q9NS68 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF19Q9NS68 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF19Q9NS68 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF19Q9NS68 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF19Q9NS68 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF19Q9NS68 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFRSF19Q9NS68 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFRSF19Q9NS68 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFRSF19Q9NS68 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF19Q9NS68 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF19Q9NS68 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFRSF19Q9NS68 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFRSF19Q9NS68 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TNFRSF19Q9NS68 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFRSF19Q9NS68 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFRSF19Q9NS68 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFRSF19Q9NS68 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFRSF19Q9NS68 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFRSF19Q9NS68 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFRSF19Q9NS68 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFRSF19Q9NS68 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFRSF19Q9NS68 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms