Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE2

NGRN, Neugrin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGRNQ9NPE2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NGRNQ9NPE2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NGRNQ9NPE2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NGRNQ9NPE2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NGRNQ9NPE2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NGRNQ9NPE2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NGRNQ9NPE2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NGRNQ9NPE2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NGRNQ9NPE2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NGRNQ9NPE2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NGRNQ9NPE2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NGRNQ9NPE2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NGRNQ9NPE2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NGRNQ9NPE2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NGRNQ9NPE2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NGRNQ9NPE2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NGRNQ9NPE2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NGRNQ9NPE2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NGRNQ9NPE2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NGRNQ9NPE2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NGRNQ9NPE2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NGRNQ9NPE2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NGRNQ9NPE2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NGRNQ9NPE2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NGRNQ9NPE2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NGRNQ9NPE2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NGRNQ9NPE2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NGRNQ9NPE2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NGRNQ9NPE2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NGRNQ9NPE2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NGRNQ9NPE2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NGRNQ9NPE2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NGRNQ9NPE2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NGRNQ9NPE2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NGRNQ9NPE2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NGRNQ9NPE2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NGRNQ9NPE2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NGRNQ9NPE2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NGRNQ9NPE2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NGRNQ9NPE2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NGRNQ9NPE2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NGRNQ9NPE2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NGRNQ9NPE2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NGRNQ9NPE2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NGRNQ9NPE2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NGRNQ9NPE2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NGRNQ9NPE2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NGRNQ9NPE2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NGRNQ9NPE2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NGRNQ9NPE2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NGRNQ9NPE2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NGRNQ9NPE2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NGRNQ9NPE2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NGRNQ9NPE2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NGRNQ9NPE2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NGRNQ9NPE2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NGRNQ9NPE2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NGRNQ9NPE2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NGRNQ9NPE2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NGRNQ9NPE2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NGRNQ9NPE2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NGRNQ9NPE2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NGRNQ9NPE2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NGRNQ9NPE2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NGRNQ9NPE2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NGRNQ9NPE2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NGRNQ9NPE2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NGRNQ9NPE2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NGRNQ9NPE2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NGRNQ9NPE2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NGRNQ9NPE2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NGRNQ9NPE2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NGRNQ9NPE2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NGRNQ9NPE2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NGRNQ9NPE2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NGRNQ9NPE2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NGRNQ9NPE2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NGRNQ9NPE2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NGRNQ9NPE2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NGRNQ9NPE2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NGRNQ9NPE2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NGRNQ9NPE2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NGRNQ9NPE2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NGRNQ9NPE2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NGRNQ9NPE2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NGRNQ9NPE2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NGRNQ9NPE2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NGRNQ9NPE2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NGRNQ9NPE2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NGRNQ9NPE2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NGRNQ9NPE2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NGRNQ9NPE2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NGRNQ9NPE2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NGRNQ9NPE2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NGRNQ9NPE2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NGRNQ9NPE2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NGRNQ9NPE2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NGRNQ9NPE2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NGRNQ9NPE2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NGRNQ9NPE2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms