Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PREBQ9HCU5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PREBQ9HCU5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PREBQ9HCU5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PREBQ9HCU5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PREBQ9HCU5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PREBQ9HCU5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PREBQ9HCU5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PREBQ9HCU5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PREBQ9HCU5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PREBQ9HCU5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PREBQ9HCU5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PREBQ9HCU5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PREBQ9HCU5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PREBQ9HCU5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PREBQ9HCU5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PREBQ9HCU5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PREBQ9HCU5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PREBQ9HCU5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PREBQ9HCU5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PREBQ9HCU5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PREBQ9HCU5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PREBQ9HCU5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PREBQ9HCU5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PREBQ9HCU5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PREBQ9HCU5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PREBQ9HCU5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PREBQ9HCU5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PREBQ9HCU5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PREBQ9HCU5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PREBQ9HCU5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PREBQ9HCU5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PREBQ9HCU5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PREBQ9HCU5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PREBQ9HCU5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PREBQ9HCU5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PREBQ9HCU5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PREBQ9HCU5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PREBQ9HCU5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PREBQ9HCU5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PREBQ9HCU5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PREBQ9HCU5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PREBQ9HCU5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PREBQ9HCU5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PREBQ9HCU5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PREBQ9HCU5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PREBQ9HCU5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PREBQ9HCU5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PREBQ9HCU5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PREBQ9HCU5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PREBQ9HCU5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PREBQ9HCU5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PREBQ9HCU5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PREBQ9HCU5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PREBQ9HCU5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PREBQ9HCU5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PREBQ9HCU5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PREBQ9HCU5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PREBQ9HCU5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PREBQ9HCU5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PREBQ9HCU5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PREBQ9HCU5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PREBQ9HCU5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PREBQ9HCU5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PREBQ9HCU5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PREBQ9HCU5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PREBQ9HCU5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PREBQ9HCU5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PREBQ9HCU5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PREBQ9HCU5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PREBQ9HCU5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PREBQ9HCU5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PREBQ9HCU5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PREBQ9HCU5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PREBQ9HCU5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PREBQ9HCU5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PREBQ9HCU5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PREBQ9HCU5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PREBQ9HCU5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PREBQ9HCU5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PREBQ9HCU5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PREBQ9HCU5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PREBQ9HCU5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PREBQ9HCU5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PREBQ9HCU5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PREBQ9HCU5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PREBQ9HCU5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PREBQ9HCU5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PREBQ9HCU5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PREBQ9HCU5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PREBQ9HCU5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PREBQ9HCU5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PREBQ9HCU5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PREBQ9HCU5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PREBQ9HCU5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PREBQ9HCU5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PREBQ9HCU5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PREBQ9HCU5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PREBQ9HCU5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PREBQ9HCU5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.5 ms