Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
USP29Q9HBJ7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP29Q9HBJ7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP29Q9HBJ7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP29Q9HBJ7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP29Q9HBJ7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP29Q9HBJ7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP29Q9HBJ7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP29Q9HBJ7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP29Q9HBJ7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP29Q9HBJ7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP29Q9HBJ7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP29Q9HBJ7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP29Q9HBJ7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP29Q9HBJ7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP29Q9HBJ7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP29Q9HBJ7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP29Q9HBJ7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP29Q9HBJ7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP29Q9HBJ7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP29Q9HBJ7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP29Q9HBJ7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP29Q9HBJ7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP29Q9HBJ7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP29Q9HBJ7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP29Q9HBJ7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP29Q9HBJ7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP29Q9HBJ7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP29Q9HBJ7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP29Q9HBJ7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP29Q9HBJ7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP29Q9HBJ7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP29Q9HBJ7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP29Q9HBJ7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
USP29Q9HBJ7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP29Q9HBJ7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
USP29Q9HBJ7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP29Q9HBJ7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP29Q9HBJ7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
USP29Q9HBJ7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP29Q9HBJ7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP29Q9HBJ7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP29Q9HBJ7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP29Q9HBJ7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP29Q9HBJ7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP29Q9HBJ7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP29Q9HBJ7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP29Q9HBJ7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP29Q9HBJ7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP29Q9HBJ7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP29Q9HBJ7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP29Q9HBJ7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP29Q9HBJ7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP29Q9HBJ7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP29Q9HBJ7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP29Q9HBJ7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP29Q9HBJ7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP29Q9HBJ7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP29Q9HBJ7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP29Q9HBJ7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP29Q9HBJ7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP29Q9HBJ7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USP29Q9HBJ7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP29Q9HBJ7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP29Q9HBJ7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP29Q9HBJ7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP29Q9HBJ7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP29Q9HBJ7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP29Q9HBJ7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP29Q9HBJ7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP29Q9HBJ7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP29Q9HBJ7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP29Q9HBJ7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP29Q9HBJ7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP29Q9HBJ7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP29Q9HBJ7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP29Q9HBJ7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP29Q9HBJ7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP29Q9HBJ7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP29Q9HBJ7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP29Q9HBJ7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP29Q9HBJ7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP29Q9HBJ7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP29Q9HBJ7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP29Q9HBJ7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP29Q9HBJ7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP29Q9HBJ7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
USP29Q9HBJ7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP29Q9HBJ7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP29Q9HBJ7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP29Q9HBJ7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
USP29Q9HBJ7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP29Q9HBJ7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP29Q9HBJ7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP29Q9HBJ7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
USP29Q9HBJ7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP29Q9HBJ7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP29Q9HBJ7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP29Q9HBJ7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP29Q9HBJ7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms