Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CITED4Q96RK1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CITED4Q96RK1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CITED4Q96RK1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CITED4Q96RK1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CITED4Q96RK1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CITED4Q96RK1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CITED4Q96RK1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CITED4Q96RK1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CITED4Q96RK1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CITED4Q96RK1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CITED4Q96RK1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CITED4Q96RK1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CITED4Q96RK1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CITED4Q96RK1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CITED4Q96RK1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CITED4Q96RK1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CITED4Q96RK1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CITED4Q96RK1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CITED4Q96RK1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CITED4Q96RK1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CITED4Q96RK1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CITED4Q96RK1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CITED4Q96RK1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CITED4Q96RK1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CITED4Q96RK1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CITED4Q96RK1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CITED4Q96RK1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CITED4Q96RK1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CITED4Q96RK1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CITED4Q96RK1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CITED4Q96RK1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CITED4Q96RK1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CITED4Q96RK1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CITED4Q96RK1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CITED4Q96RK1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CITED4Q96RK1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CITED4Q96RK1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CITED4Q96RK1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CITED4Q96RK1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CITED4Q96RK1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CITED4Q96RK1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CITED4Q96RK1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CITED4Q96RK1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CITED4Q96RK1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CITED4Q96RK1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CITED4Q96RK1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CITED4Q96RK1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CITED4Q96RK1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CITED4Q96RK1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CITED4Q96RK1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CITED4Q96RK1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CITED4Q96RK1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CITED4Q96RK1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CITED4Q96RK1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CITED4Q96RK1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CITED4Q96RK1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CITED4Q96RK1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CITED4Q96RK1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CITED4Q96RK1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CITED4Q96RK1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CITED4Q96RK1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CITED4Q96RK1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CITED4Q96RK1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CITED4Q96RK1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CITED4Q96RK1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CITED4Q96RK1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CITED4Q96RK1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CITED4Q96RK1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CITED4Q96RK1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CITED4Q96RK1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CITED4Q96RK1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CITED4Q96RK1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CITED4Q96RK1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CITED4Q96RK1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CITED4Q96RK1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CITED4Q96RK1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CITED4Q96RK1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CITED4Q96RK1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CITED4Q96RK1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CITED4Q96RK1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CITED4Q96RK1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CITED4Q96RK1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CITED4Q96RK1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CITED4Q96RK1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CITED4Q96RK1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CITED4Q96RK1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CITED4Q96RK1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CITED4Q96RK1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CITED4Q96RK1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CITED4Q96RK1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CITED4Q96RK1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CITED4Q96RK1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITED4Q96RK1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITED4Q96RK1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITED4Q96RK1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITED4Q96RK1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITED4Q96RK1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITED4Q96RK1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CITED4Q96RK1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms