Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF2

STAC3, SH3 and cysteine-rich domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAC3Q96MF2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
STAC3Q96MF2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
STAC3Q96MF2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
STAC3Q96MF2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
STAC3Q96MF2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
STAC3Q96MF2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
STAC3Q96MF2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
STAC3Q96MF2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
STAC3Q96MF2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
STAC3Q96MF2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
STAC3Q96MF2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
STAC3Q96MF2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
STAC3Q96MF2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
STAC3Q96MF2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
STAC3Q96MF2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
STAC3Q96MF2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
STAC3Q96MF2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
STAC3Q96MF2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
STAC3Q96MF2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
STAC3Q96MF2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
STAC3Q96MF2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
STAC3Q96MF2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
STAC3Q96MF2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC37.67■■■■□ 3.62
STAC3Q96MF2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
STAC3Q96MF2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
STAC3Q96MF2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
STAC3Q96MF2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
STAC3Q96MF2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
STAC3Q96MF2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
STAC3Q96MF2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
STAC3Q96MF2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
STAC3Q96MF2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
STAC3Q96MF2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
STAC3Q96MF2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
STAC3Q96MF2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
STAC3Q96MF2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
STAC3Q96MF2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
STAC3Q96MF2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
STAC3Q96MF2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
STAC3Q96MF2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
STAC3Q96MF2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
STAC3Q96MF2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
STAC3Q96MF2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
STAC3Q96MF2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
STAC3Q96MF2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC37.58■■■■□ 3.61
STAC3Q96MF2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
STAC3Q96MF2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
STAC3Q96MF2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
STAC3Q96MF2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
STAC3Q96MF2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
STAC3Q96MF2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
STAC3Q96MF2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
STAC3Q96MF2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.54■■■■□ 3.6
STAC3Q96MF2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.54■■■■□ 3.6
STAC3Q96MF2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
STAC3Q96MF2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
STAC3Q96MF2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
STAC3Q96MF2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC37.51■■■■□ 3.6
STAC3Q96MF2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
STAC3Q96MF2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
STAC3Q96MF2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
STAC3Q96MF2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
STAC3Q96MF2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
STAC3Q96MF2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
STAC3Q96MF2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
STAC3Q96MF2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
STAC3Q96MF2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
STAC3Q96MF2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
STAC3Q96MF2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
STAC3Q96MF2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
STAC3Q96MF2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
STAC3Q96MF2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
STAC3Q96MF2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
STAC3Q96MF2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
STAC3Q96MF2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
STAC3Q96MF2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
STAC3Q96MF2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
STAC3Q96MF2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
STAC3Q96MF2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
STAC3Q96MF2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
STAC3Q96MF2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
STAC3Q96MF2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
STAC3Q96MF2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
STAC3Q96MF2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
STAC3Q96MF2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
STAC3Q96MF2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
STAC3Q96MF2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
STAC3Q96MF2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
STAC3Q96MF2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
STAC3Q96MF2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
STAC3Q96MF2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
STAC3Q96MF2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
STAC3Q96MF2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
STAC3Q96MF2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
STAC3Q96MF2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
STAC3Q96MF2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
STAC3Q96MF2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
STAC3Q96MF2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
STAC3Q96MF2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
STAC3Q96MF2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms