Protein–RNA interactions for Protein: Q96GZ6

SLC41A3, Solute carrier family 41 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A3Q96GZ6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC41A3Q96GZ6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC41A3Q96GZ6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC41A3Q96GZ6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC41A3Q96GZ6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC41A3Q96GZ6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC41A3Q96GZ6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC41A3Q96GZ6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC41A3Q96GZ6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC41A3Q96GZ6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC41A3Q96GZ6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC41A3Q96GZ6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC41A3Q96GZ6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC41A3Q96GZ6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC41A3Q96GZ6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC41A3Q96GZ6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC41A3Q96GZ6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC41A3Q96GZ6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC41A3Q96GZ6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC41A3Q96GZ6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC41A3Q96GZ6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC41A3Q96GZ6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC41A3Q96GZ6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC41A3Q96GZ6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC41A3Q96GZ6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC41A3Q96GZ6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC41A3Q96GZ6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC41A3Q96GZ6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC41A3Q96GZ6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC41A3Q96GZ6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC41A3Q96GZ6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC41A3Q96GZ6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC41A3Q96GZ6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC41A3Q96GZ6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC41A3Q96GZ6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC41A3Q96GZ6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC41A3Q96GZ6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC41A3Q96GZ6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC41A3Q96GZ6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC41A3Q96GZ6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC41A3Q96GZ6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC41A3Q96GZ6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC41A3Q96GZ6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC41A3Q96GZ6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC41A3Q96GZ6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC41A3Q96GZ6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC41A3Q96GZ6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC41A3Q96GZ6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC41A3Q96GZ6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC41A3Q96GZ6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC41A3Q96GZ6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC41A3Q96GZ6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC41A3Q96GZ6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC41A3Q96GZ6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC41A3Q96GZ6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC41A3Q96GZ6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC41A3Q96GZ6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC41A3Q96GZ6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC41A3Q96GZ6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC41A3Q96GZ6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC41A3Q96GZ6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC41A3Q96GZ6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC41A3Q96GZ6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC41A3Q96GZ6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC41A3Q96GZ6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC41A3Q96GZ6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC41A3Q96GZ6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC41A3Q96GZ6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC41A3Q96GZ6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC41A3Q96GZ6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC41A3Q96GZ6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC41A3Q96GZ6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC41A3Q96GZ6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC41A3Q96GZ6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC41A3Q96GZ6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC41A3Q96GZ6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC41A3Q96GZ6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC41A3Q96GZ6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC41A3Q96GZ6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC41A3Q96GZ6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC41A3Q96GZ6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC41A3Q96GZ6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC41A3Q96GZ6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC41A3Q96GZ6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC41A3Q96GZ6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC41A3Q96GZ6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC41A3Q96GZ6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC41A3Q96GZ6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC41A3Q96GZ6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC41A3Q96GZ6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC41A3Q96GZ6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC41A3Q96GZ6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC41A3Q96GZ6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC41A3Q96GZ6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC41A3Q96GZ6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC41A3Q96GZ6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC41A3Q96GZ6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC41A3Q96GZ6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC41A3Q96GZ6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC41A3Q96GZ6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms