Protein–RNA interactions for Protein: Q96C10

DHX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX58Q96C10 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DHX58Q96C10 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
DHX58Q96C10 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
DHX58Q96C10 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DHX58Q96C10 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DHX58Q96C10 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DHX58Q96C10 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DHX58Q96C10 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DHX58Q96C10 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DHX58Q96C10 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DHX58Q96C10 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DHX58Q96C10 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DHX58Q96C10 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DHX58Q96C10 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DHX58Q96C10 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DHX58Q96C10 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DHX58Q96C10 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DHX58Q96C10 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DHX58Q96C10 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DHX58Q96C10 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DHX58Q96C10 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DHX58Q96C10 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DHX58Q96C10 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DHX58Q96C10 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DHX58Q96C10 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DHX58Q96C10 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DHX58Q96C10 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DHX58Q96C10 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DHX58Q96C10 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DHX58Q96C10 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DHX58Q96C10 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DHX58Q96C10 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DHX58Q96C10 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DHX58Q96C10 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DHX58Q96C10 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DHX58Q96C10 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DHX58Q96C10 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
DHX58Q96C10 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DHX58Q96C10 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DHX58Q96C10 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DHX58Q96C10 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DHX58Q96C10 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DHX58Q96C10 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DHX58Q96C10 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DHX58Q96C10 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DHX58Q96C10 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DHX58Q96C10 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DHX58Q96C10 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DHX58Q96C10 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DHX58Q96C10 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DHX58Q96C10 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DHX58Q96C10 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DHX58Q96C10 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DHX58Q96C10 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DHX58Q96C10 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DHX58Q96C10 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DHX58Q96C10 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
DHX58Q96C10 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DHX58Q96C10 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DHX58Q96C10 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DHX58Q96C10 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DHX58Q96C10 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DHX58Q96C10 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
DHX58Q96C10 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
DHX58Q96C10 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DHX58Q96C10 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DHX58Q96C10 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DHX58Q96C10 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DHX58Q96C10 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DHX58Q96C10 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
DHX58Q96C10 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DHX58Q96C10 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DHX58Q96C10 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DHX58Q96C10 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DHX58Q96C10 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DHX58Q96C10 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DHX58Q96C10 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DHX58Q96C10 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DHX58Q96C10 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DHX58Q96C10 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DHX58Q96C10 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DHX58Q96C10 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DHX58Q96C10 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DHX58Q96C10 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DHX58Q96C10 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DHX58Q96C10 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DHX58Q96C10 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DHX58Q96C10 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DHX58Q96C10 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DHX58Q96C10 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DHX58Q96C10 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DHX58Q96C10 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DHX58Q96C10 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DHX58Q96C10 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DHX58Q96C10 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DHX58Q96C10 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DHX58Q96C10 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
DHX58Q96C10 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DHX58Q96C10 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DHX58Q96C10 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms