Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
LINC00301Q8NCQ3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LINC00301Q8NCQ3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LINC00301Q8NCQ3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LINC00301Q8NCQ3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LINC00301Q8NCQ3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
LINC00301Q8NCQ3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LINC00301Q8NCQ3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LINC00301Q8NCQ3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LINC00301Q8NCQ3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
LINC00301Q8NCQ3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
LINC00301Q8NCQ3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LINC00301Q8NCQ3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LINC00301Q8NCQ3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
LINC00301Q8NCQ3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LINC00301Q8NCQ3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LINC00301Q8NCQ3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LINC00301Q8NCQ3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LINC00301Q8NCQ3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LINC00301Q8NCQ3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LINC00301Q8NCQ3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
LINC00301Q8NCQ3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
LINC00301Q8NCQ3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LINC00301Q8NCQ3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LINC00301Q8NCQ3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LINC00301Q8NCQ3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LINC00301Q8NCQ3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LINC00301Q8NCQ3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LINC00301Q8NCQ3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LINC00301Q8NCQ3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LINC00301Q8NCQ3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LINC00301Q8NCQ3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LINC00301Q8NCQ3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LINC00301Q8NCQ3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LINC00301Q8NCQ3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LINC00301Q8NCQ3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LINC00301Q8NCQ3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LINC00301Q8NCQ3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
LINC00301Q8NCQ3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LINC00301Q8NCQ3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LINC00301Q8NCQ3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LINC00301Q8NCQ3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LINC00301Q8NCQ3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LINC00301Q8NCQ3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LINC00301Q8NCQ3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LINC00301Q8NCQ3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LINC00301Q8NCQ3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LINC00301Q8NCQ3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LINC00301Q8NCQ3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LINC00301Q8NCQ3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LINC00301Q8NCQ3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LINC00301Q8NCQ3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LINC00301Q8NCQ3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LINC00301Q8NCQ3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LINC00301Q8NCQ3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LINC00301Q8NCQ3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LINC00301Q8NCQ3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LINC00301Q8NCQ3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LINC00301Q8NCQ3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LINC00301Q8NCQ3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
LINC00301Q8NCQ3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LINC00301Q8NCQ3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LINC00301Q8NCQ3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LINC00301Q8NCQ3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LINC00301Q8NCQ3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LINC00301Q8NCQ3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LINC00301Q8NCQ3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LINC00301Q8NCQ3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LINC00301Q8NCQ3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
LINC00301Q8NCQ3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LINC00301Q8NCQ3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LINC00301Q8NCQ3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LINC00301Q8NCQ3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LINC00301Q8NCQ3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LINC00301Q8NCQ3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LINC00301Q8NCQ3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LINC00301Q8NCQ3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LINC00301Q8NCQ3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LINC00301Q8NCQ3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LINC00301Q8NCQ3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LINC00301Q8NCQ3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LINC00301Q8NCQ3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LINC00301Q8NCQ3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LINC00301Q8NCQ3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LINC00301Q8NCQ3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LINC00301Q8NCQ3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LINC00301Q8NCQ3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LINC00301Q8NCQ3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LINC00301Q8NCQ3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LINC00301Q8NCQ3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LINC00301Q8NCQ3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LINC00301Q8NCQ3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LINC00301Q8NCQ3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LINC00301Q8NCQ3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LINC00301Q8NCQ3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LINC00301Q8NCQ3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LINC00301Q8NCQ3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LINC00301Q8NCQ3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LINC00301Q8NCQ3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LINC00301Q8NCQ3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms