Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1W1

ARHGEF28, Rho guanine nucleotide exchange factor 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF28Q8N1W1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ARHGEF28Q8N1W1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ARHGEF28Q8N1W1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ARHGEF28Q8N1W1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ARHGEF28Q8N1W1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
ARHGEF28Q8N1W1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
ARHGEF28Q8N1W1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
ARHGEF28Q8N1W1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ARHGEF28Q8N1W1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ARHGEF28Q8N1W1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
ARHGEF28Q8N1W1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ARHGEF28Q8N1W1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
ARHGEF28Q8N1W1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
ARHGEF28Q8N1W1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
ARHGEF28Q8N1W1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ARHGEF28Q8N1W1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ARHGEF28Q8N1W1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
ARHGEF28Q8N1W1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ARHGEF28Q8N1W1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
ARHGEF28Q8N1W1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ARHGEF28Q8N1W1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
ARHGEF28Q8N1W1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ARHGEF28Q8N1W1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ARHGEF28Q8N1W1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
ARHGEF28Q8N1W1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ARHGEF28Q8N1W1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
ARHGEF28Q8N1W1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
ARHGEF28Q8N1W1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ARHGEF28Q8N1W1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ARHGEF28Q8N1W1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC37.13■■■■□ 3.53
ARHGEF28Q8N1W1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
ARHGEF28Q8N1W1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
ARHGEF28Q8N1W1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
ARHGEF28Q8N1W1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
ARHGEF28Q8N1W1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
ARHGEF28Q8N1W1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
ARHGEF28Q8N1W1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
ARHGEF28Q8N1W1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
ARHGEF28Q8N1W1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
ARHGEF28Q8N1W1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
ARHGEF28Q8N1W1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
ARHGEF28Q8N1W1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
ARHGEF28Q8N1W1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ARHGEF28Q8N1W1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ARHGEF28Q8N1W1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ARHGEF28Q8N1W1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ARHGEF28Q8N1W1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
ARHGEF28Q8N1W1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ARHGEF28Q8N1W1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
ARHGEF28Q8N1W1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ARHGEF28Q8N1W1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ARHGEF28Q8N1W1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ARHGEF28Q8N1W1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ARHGEF28Q8N1W1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ARHGEF28Q8N1W1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ARHGEF28Q8N1W1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ARHGEF28Q8N1W1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ARHGEF28Q8N1W1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ARHGEF28Q8N1W1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
ARHGEF28Q8N1W1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
ARHGEF28Q8N1W1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
ARHGEF28Q8N1W1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
ARHGEF28Q8N1W1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ARHGEF28Q8N1W1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
ARHGEF28Q8N1W1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
ARHGEF28Q8N1W1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
ARHGEF28Q8N1W1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
ARHGEF28Q8N1W1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
ARHGEF28Q8N1W1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
ARHGEF28Q8N1W1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
ARHGEF28Q8N1W1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
ARHGEF28Q8N1W1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
ARHGEF28Q8N1W1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
ARHGEF28Q8N1W1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ARHGEF28Q8N1W1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ARHGEF28Q8N1W1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
ARHGEF28Q8N1W1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ARHGEF28Q8N1W1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ARHGEF28Q8N1W1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.9■■■■□ 3.5
ARHGEF28Q8N1W1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ARHGEF28Q8N1W1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ARHGEF28Q8N1W1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ARHGEF28Q8N1W1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
ARHGEF28Q8N1W1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ARHGEF28Q8N1W1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ARHGEF28Q8N1W1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ARHGEF28Q8N1W1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ARHGEF28Q8N1W1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ARHGEF28Q8N1W1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
ARHGEF28Q8N1W1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ARHGEF28Q8N1W1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ARHGEF28Q8N1W1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ARHGEF28Q8N1W1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ARHGEF28Q8N1W1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ARHGEF28Q8N1W1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
ARHGEF28Q8N1W1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ARHGEF28Q8N1W1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ARHGEF28Q8N1W1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
ARHGEF28Q8N1W1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
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