Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LPCAT2Q7L5N7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LPCAT2Q7L5N7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LPCAT2Q7L5N7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LPCAT2Q7L5N7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LPCAT2Q7L5N7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LPCAT2Q7L5N7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LPCAT2Q7L5N7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LPCAT2Q7L5N7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LPCAT2Q7L5N7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LPCAT2Q7L5N7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LPCAT2Q7L5N7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LPCAT2Q7L5N7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LPCAT2Q7L5N7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LPCAT2Q7L5N7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LPCAT2Q7L5N7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LPCAT2Q7L5N7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LPCAT2Q7L5N7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LPCAT2Q7L5N7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LPCAT2Q7L5N7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LPCAT2Q7L5N7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LPCAT2Q7L5N7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LPCAT2Q7L5N7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LPCAT2Q7L5N7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LPCAT2Q7L5N7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LPCAT2Q7L5N7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LPCAT2Q7L5N7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LPCAT2Q7L5N7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LPCAT2Q7L5N7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LPCAT2Q7L5N7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LPCAT2Q7L5N7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LPCAT2Q7L5N7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LPCAT2Q7L5N7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LPCAT2Q7L5N7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LPCAT2Q7L5N7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LPCAT2Q7L5N7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LPCAT2Q7L5N7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LPCAT2Q7L5N7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LPCAT2Q7L5N7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LPCAT2Q7L5N7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LPCAT2Q7L5N7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LPCAT2Q7L5N7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LPCAT2Q7L5N7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LPCAT2Q7L5N7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LPCAT2Q7L5N7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LPCAT2Q7L5N7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LPCAT2Q7L5N7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LPCAT2Q7L5N7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LPCAT2Q7L5N7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LPCAT2Q7L5N7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LPCAT2Q7L5N7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LPCAT2Q7L5N7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LPCAT2Q7L5N7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LPCAT2Q7L5N7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LPCAT2Q7L5N7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LPCAT2Q7L5N7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LPCAT2Q7L5N7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LPCAT2Q7L5N7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LPCAT2Q7L5N7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LPCAT2Q7L5N7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LPCAT2Q7L5N7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LPCAT2Q7L5N7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LPCAT2Q7L5N7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LPCAT2Q7L5N7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LPCAT2Q7L5N7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LPCAT2Q7L5N7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LPCAT2Q7L5N7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LPCAT2Q7L5N7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LPCAT2Q7L5N7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LPCAT2Q7L5N7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LPCAT2Q7L5N7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LPCAT2Q7L5N7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LPCAT2Q7L5N7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LPCAT2Q7L5N7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LPCAT2Q7L5N7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LPCAT2Q7L5N7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LPCAT2Q7L5N7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LPCAT2Q7L5N7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LPCAT2Q7L5N7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LPCAT2Q7L5N7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LPCAT2Q7L5N7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LPCAT2Q7L5N7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LPCAT2Q7L5N7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LPCAT2Q7L5N7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LPCAT2Q7L5N7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LPCAT2Q7L5N7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LPCAT2Q7L5N7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LPCAT2Q7L5N7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LPCAT2Q7L5N7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LPCAT2Q7L5N7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LPCAT2Q7L5N7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LPCAT2Q7L5N7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LPCAT2Q7L5N7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LPCAT2Q7L5N7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LPCAT2Q7L5N7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LPCAT2Q7L5N7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LPCAT2Q7L5N7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LPCAT2Q7L5N7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LPCAT2Q7L5N7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LPCAT2Q7L5N7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms