Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCIMPQ6UWF3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCIMPQ6UWF3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCIMPQ6UWF3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCIMPQ6UWF3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCIMPQ6UWF3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCIMPQ6UWF3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCIMPQ6UWF3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCIMPQ6UWF3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCIMPQ6UWF3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCIMPQ6UWF3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SCIMPQ6UWF3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SCIMPQ6UWF3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCIMPQ6UWF3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCIMPQ6UWF3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCIMPQ6UWF3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCIMPQ6UWF3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCIMPQ6UWF3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCIMPQ6UWF3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCIMPQ6UWF3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCIMPQ6UWF3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCIMPQ6UWF3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCIMPQ6UWF3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCIMPQ6UWF3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCIMPQ6UWF3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCIMPQ6UWF3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCIMPQ6UWF3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCIMPQ6UWF3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCIMPQ6UWF3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCIMPQ6UWF3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCIMPQ6UWF3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCIMPQ6UWF3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCIMPQ6UWF3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCIMPQ6UWF3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCIMPQ6UWF3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCIMPQ6UWF3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCIMPQ6UWF3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCIMPQ6UWF3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCIMPQ6UWF3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCIMPQ6UWF3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCIMPQ6UWF3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SCIMPQ6UWF3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCIMPQ6UWF3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCIMPQ6UWF3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCIMPQ6UWF3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SCIMPQ6UWF3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCIMPQ6UWF3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCIMPQ6UWF3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCIMPQ6UWF3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCIMPQ6UWF3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCIMPQ6UWF3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCIMPQ6UWF3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCIMPQ6UWF3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCIMPQ6UWF3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCIMPQ6UWF3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCIMPQ6UWF3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCIMPQ6UWF3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCIMPQ6UWF3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SCIMPQ6UWF3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCIMPQ6UWF3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCIMPQ6UWF3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCIMPQ6UWF3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCIMPQ6UWF3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCIMPQ6UWF3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCIMPQ6UWF3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCIMPQ6UWF3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCIMPQ6UWF3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCIMPQ6UWF3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCIMPQ6UWF3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCIMPQ6UWF3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCIMPQ6UWF3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCIMPQ6UWF3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCIMPQ6UWF3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCIMPQ6UWF3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCIMPQ6UWF3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCIMPQ6UWF3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SCIMPQ6UWF3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCIMPQ6UWF3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCIMPQ6UWF3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCIMPQ6UWF3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCIMPQ6UWF3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SCIMPQ6UWF3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCIMPQ6UWF3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCIMPQ6UWF3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCIMPQ6UWF3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCIMPQ6UWF3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCIMPQ6UWF3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCIMPQ6UWF3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCIMPQ6UWF3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCIMPQ6UWF3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCIMPQ6UWF3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCIMPQ6UWF3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCIMPQ6UWF3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCIMPQ6UWF3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCIMPQ6UWF3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCIMPQ6UWF3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCIMPQ6UWF3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCIMPQ6UWF3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCIMPQ6UWF3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCIMPQ6UWF3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms