Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SAMD1Q6SPF0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SAMD1Q6SPF0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
SAMD1Q6SPF0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SAMD1Q6SPF0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SAMD1Q6SPF0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SAMD1Q6SPF0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
SAMD1Q6SPF0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
SAMD1Q6SPF0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
SAMD1Q6SPF0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SAMD1Q6SPF0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SAMD1Q6SPF0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SAMD1Q6SPF0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SAMD1Q6SPF0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SAMD1Q6SPF0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
SAMD1Q6SPF0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
SAMD1Q6SPF0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SAMD1Q6SPF0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SAMD1Q6SPF0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SAMD1Q6SPF0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SAMD1Q6SPF0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
SAMD1Q6SPF0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SAMD1Q6SPF0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SAMD1Q6SPF0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SAMD1Q6SPF0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SAMD1Q6SPF0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SAMD1Q6SPF0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SAMD1Q6SPF0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SAMD1Q6SPF0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SAMD1Q6SPF0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SAMD1Q6SPF0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SAMD1Q6SPF0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SAMD1Q6SPF0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
SAMD1Q6SPF0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
SAMD1Q6SPF0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SAMD1Q6SPF0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SAMD1Q6SPF0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SAMD1Q6SPF0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SAMD1Q6SPF0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SAMD1Q6SPF0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SAMD1Q6SPF0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SAMD1Q6SPF0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SAMD1Q6SPF0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SAMD1Q6SPF0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
SAMD1Q6SPF0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SAMD1Q6SPF0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SAMD1Q6SPF0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SAMD1Q6SPF0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SAMD1Q6SPF0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SAMD1Q6SPF0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SAMD1Q6SPF0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SAMD1Q6SPF0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SAMD1Q6SPF0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SAMD1Q6SPF0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SAMD1Q6SPF0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SAMD1Q6SPF0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SAMD1Q6SPF0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
SAMD1Q6SPF0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SAMD1Q6SPF0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SAMD1Q6SPF0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SAMD1Q6SPF0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SAMD1Q6SPF0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SAMD1Q6SPF0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SAMD1Q6SPF0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SAMD1Q6SPF0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SAMD1Q6SPF0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SAMD1Q6SPF0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SAMD1Q6SPF0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SAMD1Q6SPF0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SAMD1Q6SPF0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SAMD1Q6SPF0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SAMD1Q6SPF0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SAMD1Q6SPF0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SAMD1Q6SPF0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SAMD1Q6SPF0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SAMD1Q6SPF0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SAMD1Q6SPF0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SAMD1Q6SPF0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SAMD1Q6SPF0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SAMD1Q6SPF0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SAMD1Q6SPF0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SAMD1Q6SPF0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SAMD1Q6SPF0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SAMD1Q6SPF0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SAMD1Q6SPF0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SAMD1Q6SPF0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SAMD1Q6SPF0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SAMD1Q6SPF0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SAMD1Q6SPF0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SAMD1Q6SPF0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SAMD1Q6SPF0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SAMD1Q6SPF0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SAMD1Q6SPF0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SAMD1Q6SPF0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SAMD1Q6SPF0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SAMD1Q6SPF0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SAMD1Q6SPF0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SAMD1Q6SPF0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SAMD1Q6SPF0 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
SAMD1Q6SPF0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms