Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1K8

GTF2H2C, General transcription factor IIH subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2CQ6P1K8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2H2CQ6P1K8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2H2CQ6P1K8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2H2CQ6P1K8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2H2CQ6P1K8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2H2CQ6P1K8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2H2CQ6P1K8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2H2CQ6P1K8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2H2CQ6P1K8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2H2CQ6P1K8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2H2CQ6P1K8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
GTF2H2CQ6P1K8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2H2CQ6P1K8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2H2CQ6P1K8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2H2CQ6P1K8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2H2CQ6P1K8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2H2CQ6P1K8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2H2CQ6P1K8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2H2CQ6P1K8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2H2CQ6P1K8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2H2CQ6P1K8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2H2CQ6P1K8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2H2CQ6P1K8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2H2CQ6P1K8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2H2CQ6P1K8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2H2CQ6P1K8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2H2CQ6P1K8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2H2CQ6P1K8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2H2CQ6P1K8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2H2CQ6P1K8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2H2CQ6P1K8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GTF2H2CQ6P1K8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2H2CQ6P1K8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2H2CQ6P1K8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2H2CQ6P1K8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2H2CQ6P1K8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2H2CQ6P1K8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2H2CQ6P1K8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2H2CQ6P1K8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2H2CQ6P1K8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2H2CQ6P1K8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2H2CQ6P1K8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2H2CQ6P1K8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2H2CQ6P1K8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2H2CQ6P1K8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2H2CQ6P1K8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2H2CQ6P1K8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2H2CQ6P1K8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTF2H2CQ6P1K8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2H2CQ6P1K8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2H2CQ6P1K8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2H2CQ6P1K8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2H2CQ6P1K8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2H2CQ6P1K8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2H2CQ6P1K8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2H2CQ6P1K8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2H2CQ6P1K8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2H2CQ6P1K8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2H2CQ6P1K8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2H2CQ6P1K8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2H2CQ6P1K8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2H2CQ6P1K8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2H2CQ6P1K8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2H2CQ6P1K8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2H2CQ6P1K8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2H2CQ6P1K8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2H2CQ6P1K8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2H2CQ6P1K8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2H2CQ6P1K8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2H2CQ6P1K8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2H2CQ6P1K8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2H2CQ6P1K8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2H2CQ6P1K8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2H2CQ6P1K8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2H2CQ6P1K8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2H2CQ6P1K8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2H2CQ6P1K8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2H2CQ6P1K8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2H2CQ6P1K8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2H2CQ6P1K8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2H2CQ6P1K8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2H2CQ6P1K8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2H2CQ6P1K8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2H2CQ6P1K8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2H2CQ6P1K8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2H2CQ6P1K8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2H2CQ6P1K8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2H2CQ6P1K8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2H2CQ6P1K8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2H2CQ6P1K8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2H2CQ6P1K8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2H2CQ6P1K8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2H2CQ6P1K8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2H2CQ6P1K8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2H2CQ6P1K8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2H2CQ6P1K8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2H2CQ6P1K8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2H2CQ6P1K8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2H2CQ6P1K8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2H2CQ6P1K8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms