Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL39P5Q59GN2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL39P5Q59GN2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL39P5Q59GN2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL39P5Q59GN2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL39P5Q59GN2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL39P5Q59GN2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RPL39P5Q59GN2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL39P5Q59GN2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL39P5Q59GN2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL39P5Q59GN2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL39P5Q59GN2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL39P5Q59GN2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL39P5Q59GN2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL39P5Q59GN2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL39P5Q59GN2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL39P5Q59GN2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL39P5Q59GN2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL39P5Q59GN2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL39P5Q59GN2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL39P5Q59GN2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL39P5Q59GN2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL39P5Q59GN2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL39P5Q59GN2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL39P5Q59GN2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL39P5Q59GN2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL39P5Q59GN2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL39P5Q59GN2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL39P5Q59GN2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL39P5Q59GN2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL39P5Q59GN2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL39P5Q59GN2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL39P5Q59GN2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL39P5Q59GN2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL39P5Q59GN2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL39P5Q59GN2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL39P5Q59GN2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL39P5Q59GN2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL39P5Q59GN2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL39P5Q59GN2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL39P5Q59GN2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL39P5Q59GN2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL39P5Q59GN2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL39P5Q59GN2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL39P5Q59GN2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL39P5Q59GN2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL39P5Q59GN2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL39P5Q59GN2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL39P5Q59GN2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL39P5Q59GN2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL39P5Q59GN2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL39P5Q59GN2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL39P5Q59GN2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RPL39P5Q59GN2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL39P5Q59GN2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL39P5Q59GN2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL39P5Q59GN2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL39P5Q59GN2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL39P5Q59GN2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL39P5Q59GN2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL39P5Q59GN2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL39P5Q59GN2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL39P5Q59GN2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL39P5Q59GN2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL39P5Q59GN2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL39P5Q59GN2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL39P5Q59GN2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL39P5Q59GN2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL39P5Q59GN2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL39P5Q59GN2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL39P5Q59GN2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL39P5Q59GN2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL39P5Q59GN2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL39P5Q59GN2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPL39P5Q59GN2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL39P5Q59GN2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL39P5Q59GN2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL39P5Q59GN2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL39P5Q59GN2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL39P5Q59GN2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL39P5Q59GN2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL39P5Q59GN2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL39P5Q59GN2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL39P5Q59GN2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL39P5Q59GN2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL39P5Q59GN2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL39P5Q59GN2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL39P5Q59GN2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL39P5Q59GN2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL39P5Q59GN2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL39P5Q59GN2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL39P5Q59GN2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL39P5Q59GN2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL39P5Q59GN2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL39P5Q59GN2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL39P5Q59GN2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL39P5Q59GN2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL39P5Q59GN2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL39P5Q59GN2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL39P5Q59GN2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.8 ms