Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXU2

PABPC1L, Polyadenylate-binding protein 1-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PABPC1LQ4VXU2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PABPC1LQ4VXU2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PABPC1LQ4VXU2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PABPC1LQ4VXU2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PABPC1LQ4VXU2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PABPC1LQ4VXU2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PABPC1LQ4VXU2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PABPC1LQ4VXU2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PABPC1LQ4VXU2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PABPC1LQ4VXU2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PABPC1LQ4VXU2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PABPC1LQ4VXU2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PABPC1LQ4VXU2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PABPC1LQ4VXU2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PABPC1LQ4VXU2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PABPC1LQ4VXU2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PABPC1LQ4VXU2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PABPC1LQ4VXU2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PABPC1LQ4VXU2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PABPC1LQ4VXU2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PABPC1LQ4VXU2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PABPC1LQ4VXU2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PABPC1LQ4VXU2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PABPC1LQ4VXU2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PABPC1LQ4VXU2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PABPC1LQ4VXU2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PABPC1LQ4VXU2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PABPC1LQ4VXU2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PABPC1LQ4VXU2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PABPC1LQ4VXU2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PABPC1LQ4VXU2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PABPC1LQ4VXU2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PABPC1LQ4VXU2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PABPC1LQ4VXU2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PABPC1LQ4VXU2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PABPC1LQ4VXU2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PABPC1LQ4VXU2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PABPC1LQ4VXU2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PABPC1LQ4VXU2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PABPC1LQ4VXU2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PABPC1LQ4VXU2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PABPC1LQ4VXU2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PABPC1LQ4VXU2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PABPC1LQ4VXU2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PABPC1LQ4VXU2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PABPC1LQ4VXU2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PABPC1LQ4VXU2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PABPC1LQ4VXU2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PABPC1LQ4VXU2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PABPC1LQ4VXU2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PABPC1LQ4VXU2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.5 ms