Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FXNQ16595 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FXNQ16595 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FXNQ16595 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FXNQ16595 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FXNQ16595 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FXNQ16595 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
FXNQ16595 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FXNQ16595 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FXNQ16595 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FXNQ16595 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FXNQ16595 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FXNQ16595 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FXNQ16595 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FXNQ16595 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FXNQ16595 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FXNQ16595 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FXNQ16595 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FXNQ16595 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FXNQ16595 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FXNQ16595 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FXNQ16595 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FXNQ16595 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FXNQ16595 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FXNQ16595 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FXNQ16595 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FXNQ16595 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FXNQ16595 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FXNQ16595 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FXNQ16595 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FXNQ16595 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FXNQ16595 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FXNQ16595 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FXNQ16595 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FXNQ16595 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FXNQ16595 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FXNQ16595 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FXNQ16595 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FXNQ16595 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FXNQ16595 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FXNQ16595 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FXNQ16595 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FXNQ16595 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FXNQ16595 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FXNQ16595 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FXNQ16595 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FXNQ16595 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FXNQ16595 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FXNQ16595 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FXNQ16595 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FXNQ16595 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FXNQ16595 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FXNQ16595 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FXNQ16595 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FXNQ16595 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FXNQ16595 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FXNQ16595 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FXNQ16595 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FXNQ16595 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FXNQ16595 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FXNQ16595 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FXNQ16595 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FXNQ16595 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FXNQ16595 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FXNQ16595 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FXNQ16595 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FXNQ16595 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FXNQ16595 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FXNQ16595 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FXNQ16595 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FXNQ16595 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FXNQ16595 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FXNQ16595 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FXNQ16595 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FXNQ16595 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FXNQ16595 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FXNQ16595 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FXNQ16595 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FXNQ16595 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FXNQ16595 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FXNQ16595 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FXNQ16595 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FXNQ16595 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FXNQ16595 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FXNQ16595 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FXNQ16595 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FXNQ16595 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FXNQ16595 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FXNQ16595 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FXNQ16595 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FXNQ16595 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FXNQ16595 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FXNQ16595 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FXNQ16595 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FXNQ16595 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FXNQ16595 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FXNQ16595 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FXNQ16595 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FXNQ16595 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FXNQ16595 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
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