Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SQLEQ14534 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SQLEQ14534 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SQLEQ14534 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SQLEQ14534 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SQLEQ14534 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SQLEQ14534 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SQLEQ14534 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SQLEQ14534 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SQLEQ14534 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SQLEQ14534 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SQLEQ14534 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SQLEQ14534 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SQLEQ14534 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SQLEQ14534 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SQLEQ14534 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SQLEQ14534 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SQLEQ14534 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SQLEQ14534 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SQLEQ14534 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SQLEQ14534 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SQLEQ14534 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SQLEQ14534 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SQLEQ14534 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SQLEQ14534 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SQLEQ14534 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SQLEQ14534 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SQLEQ14534 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SQLEQ14534 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SQLEQ14534 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SQLEQ14534 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SQLEQ14534 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SQLEQ14534 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SQLEQ14534 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SQLEQ14534 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SQLEQ14534 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SQLEQ14534 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SQLEQ14534 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SQLEQ14534 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SQLEQ14534 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SQLEQ14534 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SQLEQ14534 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SQLEQ14534 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SQLEQ14534 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SQLEQ14534 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SQLEQ14534 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SQLEQ14534 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SQLEQ14534 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SQLEQ14534 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SQLEQ14534 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SQLEQ14534 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SQLEQ14534 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SQLEQ14534 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SQLEQ14534 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SQLEQ14534 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SQLEQ14534 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SQLEQ14534 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SQLEQ14534 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SQLEQ14534 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SQLEQ14534 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SQLEQ14534 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SQLEQ14534 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SQLEQ14534 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SQLEQ14534 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SQLEQ14534 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SQLEQ14534 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SQLEQ14534 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SQLEQ14534 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SQLEQ14534 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SQLEQ14534 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SQLEQ14534 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SQLEQ14534 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SQLEQ14534 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SQLEQ14534 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SQLEQ14534 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SQLEQ14534 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SQLEQ14534 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SQLEQ14534 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SQLEQ14534 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SQLEQ14534 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SQLEQ14534 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SQLEQ14534 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SQLEQ14534 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SQLEQ14534 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SQLEQ14534 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SQLEQ14534 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SQLEQ14534 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SQLEQ14534 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SQLEQ14534 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SQLEQ14534 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SQLEQ14534 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SQLEQ14534 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SQLEQ14534 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SQLEQ14534 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SQLEQ14534 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SQLEQ14534 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SQLEQ14534 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SQLEQ14534 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SQLEQ14534 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SQLEQ14534 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
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