Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

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Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 ADH1YOL086C 1047 nt8.39□□□□□ -1.07
HER1Q12276 TAT2YOL020W 1779 nt8.38□□□□□ -1.07
HER1Q12276 VMA11YPL234C 495 nt8.38□□□□□ -1.07
HER1Q12276 TIP1YBR067C 633 nt8.38□□□□□ -1.07
HER1Q12276 ITR2YOL103W 1830 nt8.38□□□□□ -1.07
HER1Q12276 INH1YDL181W 258 nt8.37□□□□□ -1.07
HER1Q12276 RPC31YNL151C 756 nt8.37□□□□□ -1.07
HER1Q12276 RIM2YBR192W 1134 nt8.37□□□□□ -1.07
HER1Q12276 GAL2YLR081W 1725 nt8.37□□□□□ -1.07
HER1Q12276 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.36□□□□□ -1.07
HER1Q12276 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.36□□□□□ -1.07
HER1Q12276 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.36□□□□□ -1.07
HER1Q12276 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.36□□□□□ -1.07
HER1Q12276 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.35□□□□□ -1.07
HER1Q12276 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.35□□□□□ -1.07
HER1Q12276 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.35□□□□□ -1.07
HER1Q12276 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.35□□□□□ -1.07
HER1Q12276 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.35□□□□□ -1.07
HER1Q12276 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.35□□□□□ -1.07
HER1Q12276 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.35□□□□□ -1.07
HER1Q12276 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.35□□□□□ -1.07
HER1Q12276 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.35□□□□□ -1.07
HER1Q12276 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.35□□□□□ -1.07
HER1Q12276 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.35□□□□□ -1.07
HER1Q12276 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.35□□□□□ -1.07
HER1Q12276 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.35□□□□□ -1.07
HER1Q12276 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.35□□□□□ -1.07
HER1Q12276 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.35□□□□□ -1.07
HER1Q12276 PRY1YJL079C 900 nt8.35□□□□□ -1.07
HER1Q12276 ESS1YJR017C 513 nt8.35□□□□□ -1.07
HER1Q12276 GPN2YOR262W 1044 nt8.35□□□□□ -1.07
HER1Q12276 THI72YOR192C 1800 nt8.35□□□□□ -1.07
HER1Q12276 SOL2YCR073W-A 948 nt8.34□□□□□ -1.07
HER1Q12276 YPI1YFR003C 468 nt8.34□□□□□ -1.07
HER1Q12276 MIM1YOL026C 342 nt8.34□□□□□ -1.07
HER1Q12276 MDL2YPL270W 2322 nt8.34□□□□□ -1.08
HER1Q12276 KRR1YCL059C 951 nt8.33□□□□□ -1.08
HER1Q12276 YEL008WYEL008W 381 nt8.33□□□□□ -1.08
HER1Q12276 GNP1YDR508C 1992 nt8.33□□□□□ -1.08
HER1Q12276 CPD1YGR247W 720 nt8.32□□□□□ -1.08
HER1Q12276 RAS2YNL098C 969 nt8.32□□□□□ -1.08
HER1Q12276 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt8.31□□□□□ -1.08
HER1Q12276 SNX3YOR357C 489 nt8.31□□□□□ -1.08
HER1Q12276 NME1NME1 340 nt8.31□□□□□ -1.08
HER1Q12276 LSB3YFR024C-A 1380 nt8.31□□□□□ -1.08
HER1Q12276 GTB1YDR221W 2109 nt8.3□□□□□ -1.08
HER1Q12276 DPL1YDR294C 1770 nt8.3□□□□□ -1.08
HER1Q12276 LEU4YNL104C 1860 nt8.3□□□□□ -1.08
HER1Q12276 NUC1YJL208C 990 nt8.3□□□□□ -1.08
HER1Q12276 PUS7YOR243C 2031 nt8.3□□□□□ -1.08
HER1Q12276 CSM1YCR086W 573 nt8.29□□□□□ -1.08
HER1Q12276 HXT12YIL170W 1374 nt8.27□□□□□ -1.09
HER1Q12276 LSM5YER146W 282 nt8.27□□□□□ -1.09
HER1Q12276 FET5YFL041W 1869 nt8.27□□□□□ -1.09
HER1Q12276 YDR455CYDR455C 309 nt8.26□□□□□ -1.09
HER1Q12276 HBS1YKR084C 1836 nt8.26□□□□□ -1.09
HER1Q12276 VRG4YGL225W 1014 nt8.25□□□□□ -1.09
HER1Q12276 NPP2YEL016C 1482 nt8.25□□□□□ -1.09
HER1Q12276 LSB5YCL034W 1065 nt8.24□□□□□ -1.09
HER1Q12276 DAK2YFL053W 1776 nt8.24□□□□□ -1.09
HER1Q12276 TOK1YJL093C 2076 nt8.23□□□□□ -1.09
HER1Q12276 RIB2YOL066C 1776 nt8.23□□□□□ -1.09
HER1Q12276 NAP1YKR048C 1254 nt8.23□□□□□ -1.09
HER1Q12276 PUP1YOR157C 786 nt8.23□□□□□ -1.09
HER1Q12276 Q0010Q0010 387 nt8.23□□□□□ -1.09
HER1Q12276 MTO1YGL236C 2010 nt8.22□□□□□ -1.09
HER1Q12276 YDR467CYDR467C 327 nt8.22□□□□□ -1.09
HER1Q12276 YJL055WYJL055W 738 nt8.22□□□□□ -1.09
HER1Q12276 SEN2YLR105C 1134 nt8.22□□□□□ -1.09
HER1Q12276 ERG13YML126C 1476 nt8.2□□□□□ -1.1
HER1Q12276 EAF3YPR023C 1206 nt8.2□□□□□ -1.1
HER1Q12276 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.19□□□□□ -1.1
HER1Q12276 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.19□□□□□ -1.1
HER1Q12276 UFD1YGR048W 1086 nt8.19□□□□□ -1.1
HER1Q12276 RPT5YOR117W 1305 nt8.19□□□□□ -1.1
HER1Q12276 SAM3YPL274W 1764 nt8.18□□□□□ -1.1
HER1Q12276 OYE2YHR179W 1203 nt8.18□□□□□ -1.1
HER1Q12276 YJL118WYJL118W 660 nt8.18□□□□□ -1.1
HER1Q12276 ORT1YOR130C 879 nt8.17□□□□□ -1.1
HER1Q12276 TRP2YER090W 1524 nt8.17□□□□□ -1.1
HER1Q12276 SAC7YDR389W 1965 nt8.17□□□□□ -1.1
HER1Q12276 FIT1YDR534C 1587 nt8.16□□□□□ -1.1
HER1Q12276 DUR3YHL016C 2208 nt8.16□□□□□ -1.1
HER1Q12276 YMR265CYMR265C 1386 nt8.16□□□□□ -1.1
HER1Q12276 FRA1YLL029W 2250 nt8.15□□□□□ -1.1
HER1Q12276 ELO1YJL196C 933 nt8.14□□□□□ -1.11
HER1Q12276 THI6YPL214C 1623 nt8.14□□□□□ -1.11
HER1Q12276 GAL3YDR009W 1563 nt8.14□□□□□ -1.11
HER1Q12276 HXT11YOL156W 1704 nt8.13□□□□□ -1.11
HER1Q12276 RIB7YBR153W 735 nt8.13□□□□□ -1.11
HER1Q12276 snR4snR4 186 nt8.13□□□□□ -1.11
HER1Q12276 DDI1YER143W 1287 nt8.12□□□□□ -1.11
HER1Q12276 HAP5YOR358W 729 nt8.11□□□□□ -1.11
HER1Q12276 PGC1YPL206C 966 nt8.11□□□□□ -1.11
HER1Q12276 DUS3YLR401C 2007 nt8.11□□□□□ -1.11
HER1Q12276 TPS1YBR126C 1488 nt8.11□□□□□ -1.11
HER1Q12276 RPN14YGL004C 1254 nt8.1□□□□□ -1.11
HER1Q12276 YBR232CYBR232C 360 nt8.1□□□□□ -1.11
HER1Q12276 POP2YNR052C 1302 nt8.09□□□□□ -1.11
HER1Q12276 YBL095WYBL095W 813 nt8.09□□□□□ -1.11
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