Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VIK1Q12045 ENT4YLL038C 744 nt8.57□□□□□ -1.04
VIK1Q12045 HBS1YKR084C 1836 nt8.57□□□□□ -1.04
VIK1Q12045 CSM1YCR086W 573 nt8.55□□□□□ -1.04
VIK1Q12045 RAS2YNL098C 969 nt8.55□□□□□ -1.04
VIK1Q12045 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt8.55□□□□□ -1.04
VIK1Q12045 FIT1YDR534C 1587 nt8.55□□□□□ -1.04
VIK1Q12045 PRY1YJL079C 900 nt8.53□□□□□ -1.04
VIK1Q12045 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.53□□□□□ -1.04
VIK1Q12045 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.53□□□□□ -1.04
VIK1Q12045 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.53□□□□□ -1.04
VIK1Q12045 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.53□□□□□ -1.04
VIK1Q12045 RPC31YNL151C 756 nt8.53□□□□□ -1.04
VIK1Q12045 RIM2YBR192W 1134 nt8.53□□□□□ -1.04
VIK1Q12045 SOL2YCR073W-A 948 nt8.52□□□□□ -1.05
VIK1Q12045 RAD23YEL037C 1197 nt8.52□□□□□ -1.05
VIK1Q12045 LSM5YER146W 282 nt8.52□□□□□ -1.05
VIK1Q12045 GPN2YOR262W 1044 nt8.52□□□□□ -1.05
VIK1Q12045 TAT2YOL020W 1779 nt8.51□□□□□ -1.05
VIK1Q12045 GND1YHR183W 1470 nt8.51□□□□□ -1.05
VIK1Q12045 LPD1YFL018C 1500 nt8.5□□□□□ -1.05
VIK1Q12045 KRR1YCL059C 951 nt8.5□□□□□ -1.05
VIK1Q12045 VMA11YPL234C 495 nt8.5□□□□□ -1.05
VIK1Q12045 FET5YFL041W 1869 nt8.49□□□□□ -1.05
VIK1Q12045 TIP1YBR067C 633 nt8.49□□□□□ -1.05
VIK1Q12045 FRA1YLL029W 2250 nt8.49□□□□□ -1.05
VIK1Q12045 LEU4YNL104C 1860 nt8.47□□□□□ -1.05
VIK1Q12045 DUR3YHL016C 2208 nt8.46□□□□□ -1.05
VIK1Q12045 OYE2YHR179W 1203 nt8.46□□□□□ -1.06
VIK1Q12045 SMM1YNR015W 1155 nt8.46□□□□□ -1.06
VIK1Q12045 RPT5YOR117W 1305 nt8.46□□□□□ -1.06
VIK1Q12045 MCM5YLR274W 2328 nt8.46□□□□□ -1.06
VIK1Q12045 ORT1YOR130C 879 nt8.45□□□□□ -1.06
VIK1Q12045 DPL1YDR294C 1770 nt8.45□□□□□ -1.06
VIK1Q12045 ITR2YOL103W 1830 nt8.45□□□□□ -1.06
VIK1Q12045 EAF3YPR023C 1206 nt8.44□□□□□ -1.06
VIK1Q12045 SAM3YPL274W 1764 nt8.43□□□□□ -1.06
VIK1Q12045 DUS3YLR401C 2007 nt8.43□□□□□ -1.06
VIK1Q12045 RIB3YDR487C 627 nt8.43□□□□□ -1.06
VIK1Q12045 NPP2YEL016C 1482 nt8.43□□□□□ -1.06
VIK1Q12045 YDR455CYDR455C 309 nt8.42□□□□□ -1.06
VIK1Q12045 YLR111WYLR111W 333 nt8.42□□□□□ -1.06
VIK1Q12045 SNX3YOR357C 489 nt8.42□□□□□ -1.06
VIK1Q12045 POP2YNR052C 1302 nt8.41□□□□□ -1.06
VIK1Q12045 snR4snR4 186 nt8.41□□□□□ -1.06
VIK1Q12045 TPN1YGL186C 1740 nt8.4□□□□□ -1.06
VIK1Q12045 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt8.4□□□□□ -1.06
VIK1Q12045 YJL118WYJL118W 660 nt8.4□□□□□ -1.06
VIK1Q12045 ADE16YLR028C 1776 nt8.39□□□□□ -1.07
VIK1Q12045 ERG13YML126C 1476 nt8.38□□□□□ -1.07
VIK1Q12045 LOT5YKL183W 921 nt8.38□□□□□ -1.07
VIK1Q12045 TPS1YBR126C 1488 nt8.38□□□□□ -1.07
VIK1Q12045 HXT12YIL170W 1374 nt8.37□□□□□ -1.07
VIK1Q12045 YDR467CYDR467C 327 nt8.37□□□□□ -1.07
VIK1Q12045 TRP2YER090W 1524 nt8.37□□□□□ -1.07
VIK1Q12045 LSB3YFR024C-A 1380 nt8.35□□□□□ -1.07
VIK1Q12045 CAB5YDR196C 726 nt8.34□□□□□ -1.07
VIK1Q12045 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.34□□□□□ -1.07
VIK1Q12045 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.34□□□□□ -1.07
VIK1Q12045 NSG2YNL156C 900 nt8.34□□□□□ -1.07
VIK1Q12045 RIB7YBR153W 735 nt8.34□□□□□ -1.07
VIK1Q12045 THI6YPL214C 1623 nt8.33□□□□□ -1.08
VIK1Q12045 MET30YIL046W 1923 nt8.33□□□□□ -1.08
VIK1Q12045 DDI1YER143W 1287 nt8.33□□□□□ -1.08
VIK1Q12045 VRG4YGL225W 1014 nt8.33□□□□□ -1.08
VIK1Q12045 YJL055WYJL055W 738 nt8.33□□□□□ -1.08
VIK1Q12045 HXT11YOL156W 1704 nt8.33□□□□□ -1.08
VIK1Q12045 MAS1YLR163C 1389 nt8.33□□□□□ -1.08
VIK1Q12045 GLR1YPL091W 1452 nt8.32□□□□□ -1.08
VIK1Q12045 SAC7YDR389W 1965 nt8.31□□□□□ -1.08
VIK1Q12045 TMA23YMR269W 636 nt8.31□□□□□ -1.08
VIK1Q12045 RRT8YOL048C 1029 nt8.31□□□□□ -1.08
VIK1Q12045 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt8.3□□□□□ -1.08
VIK1Q12045 YMR265CYMR265C 1386 nt8.28□□□□□ -1.08
VIK1Q12045 PFS2YNL317W 1398 nt8.28□□□□□ -1.08
VIK1Q12045 YMR226CYMR226C 804 nt8.28□□□□□ -1.08
VIK1Q12045 YNL190WYNL190W 615 nt8.28□□□□□ -1.08
VIK1Q12045 TOM71YHR117W 1920 nt8.28□□□□□ -1.08
VIK1Q12045 IMO32YGR031W 1029 nt8.27□□□□□ -1.09
VIK1Q12045 EMC3YKL207W 762 nt8.27□□□□□ -1.09
VIK1Q12045 GAL3YDR009W 1563 nt8.27□□□□□ -1.09
VIK1Q12045 RPN14YGL004C 1254 nt8.26□□□□□ -1.09
VIK1Q12045 YNR064CYNR064C 873 nt8.26□□□□□ -1.09
VIK1Q12045 SRM1YGL097W 1449 nt8.26□□□□□ -1.09
VIK1Q12045 YRF1-1YDR545W 5391 nt8.25□□□□□ -1.09
VIK1Q12045 YRF1-5YLR467W 5391 nt8.25□□□□□ -1.09
VIK1Q12045 YRF1-8YOR396W 5391 nt8.25□□□□□ -1.09
VIK1Q12045 HSV2YGR223C 1347 nt8.25□□□□□ -1.09
VIK1Q12045 ADE8YDR408C 645 nt8.24□□□□□ -1.09
VIK1Q12045 ELO1YJL196C 933 nt8.24□□□□□ -1.09
VIK1Q12045 HAP5YOR358W 729 nt8.24□□□□□ -1.09
VIK1Q12045 YJR114WYJR114W 393 nt8.23□□□□□ -1.09
VIK1Q12045 YBL095WYBL095W 813 nt8.23□□□□□ -1.09
VIK1Q12045 YLR173WYLR173W 1827 nt8.22□□□□□ -1.09
VIK1Q12045 DIA4YHR011W 1341 nt8.22□□□□□ -1.09
VIK1Q12045 AAT1YKL106W 1356 nt8.22□□□□□ -1.09
VIK1Q12045 FTH1YBR207W 1398 nt8.21□□□□□ -1.1
VIK1Q12045 KEL3YPL263C 1956 nt8.21□□□□□ -1.1
VIK1Q12045 YIL177CYIL177C 5277 nt8.2□□□□□ -1.1
VIK1Q12045 YPI1YFR003C 468 nt8.2□□□□□ -1.1
VIK1Q12045 YMR210WYMR210W 1350 nt8.2□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.3 ms