Protein–RNA interactions for Protein: Q04235

TRM12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM12Q04235 DMA2YNL116W 1569 nt8.65□□□□□ -1.02
TRM12Q04235 SAC7YDR389W 1965 nt8.65□□□□□ -1.02
TRM12Q04235 TAF13YML098W 504 nt8.65□□□□□ -1.02
TRM12Q04235 RRT8YOL048C 1029 nt8.65□□□□□ -1.02
TRM12Q04235 PSD1YNL169C 1503 nt8.64□□□□□ -1.03
TRM12Q04235 SSL2YIL143C 2532 nt8.64□□□□□ -1.03
TRM12Q04235 YHR219WYHR219W 1875 nt8.63□□□□□ -1.03
TRM12Q04235 ADE8YDR408C 645 nt8.61□□□□□ -1.03
TRM12Q04235 PAU5YFL020C 369 nt8.61□□□□□ -1.03
TRM12Q04235 IML3YBR107C 738 nt8.61□□□□□ -1.03
TRM12Q04235 YLR046CYLR046C 813 nt8.6□□□□□ -1.03
TRM12Q04235 MHF1YOL086W-A 273 nt8.6□□□□□ -1.03
TRM12Q04235 CYT1YOR065W 930 nt8.6□□□□□ -1.03
TRM12Q04235 DLD3YEL071W 1491 nt8.59□□□□□ -1.03
TRM12Q04235 SPS100YHR139C 981 nt8.59□□□□□ -1.03
TRM12Q04235 OPI3YJR073C 621 nt8.59□□□□□ -1.03
TRM12Q04235 YMR262WYMR262W 942 nt8.59□□□□□ -1.03
TRM12Q04235 ITR2YOL103W 1830 nt8.59□□□□□ -1.03
TRM12Q04235 ENT4YLL038C 744 nt8.58□□□□□ -1.04
TRM12Q04235 PGC1YPL206C 966 nt8.58□□□□□ -1.04
TRM12Q04235 POT1YIL160C 1254 nt8.56□□□□□ -1.04
TRM12Q04235 APS2YJR058C 444 nt8.56□□□□□ -1.04
TRM12Q04235 YJR114WYJR114W 393 nt8.56□□□□□ -1.04
TRM12Q04235 CWP2YKL096W-A 279 nt8.56□□□□□ -1.04
TRM12Q04235 STP3YLR375W 1032 nt8.56□□□□□ -1.04
TRM12Q04235 YHR218WYHR218W 1812 nt8.55□□□□□ -1.04
TRM12Q04235 LSR1LSR1 1175 nt8.55□□□□□ -1.04
TRM12Q04235 TVP23YDR084C 600 nt8.54□□□□□ -1.04
TRM12Q04235 NIF3YGL221C 867 nt8.54□□□□□ -1.04
TRM12Q04235 MDM35YKL053C-A 261 nt8.54□□□□□ -1.04
TRM12Q04235 SEN2YLR105C 1134 nt8.53□□□□□ -1.04
TRM12Q04235 YBR232CYBR232C 360 nt8.53□□□□□ -1.04
TRM12Q04235 RPD3YNL330C 1302 nt8.52□□□□□ -1.05
TRM12Q04235 YHL008CYHL008C 1884 nt8.51□□□□□ -1.05
TRM12Q04235 ELO1YJL196C 933 nt8.51□□□□□ -1.05
TRM12Q04235 TIM44YIL022W 1296 nt8.5□□□□□ -1.05
TRM12Q04235 GSF2YML048W 1212 nt8.5□□□□□ -1.05
TRM12Q04235 ABZ2YMR289W 1125 nt8.5□□□□□ -1.05
TRM12Q04235 YNR064CYNR064C 873 nt8.5□□□□□ -1.05
TRM12Q04235 TUB4YLR212C 1422 nt8.49□□□□□ -1.05
TRM12Q04235 NAP1YKR048C 1254 nt8.49□□□□□ -1.05
TRM12Q04235 HXT10YFL011W 1641 nt8.47□□□□□ -1.05
TRM12Q04235 VMA11YPL234C 495 nt8.47□□□□□ -1.05
TRM12Q04235 SFL1YOR140W 2301 nt8.46□□□□□ -1.05
TRM12Q04235 CDD1YLR245C 429 nt8.45□□□□□ -1.06
TRM12Q04235 SUV3YPL029W 2214 nt8.44□□□□□ -1.06
TRM12Q04235 PAR32YDL173W 888 nt8.44□□□□□ -1.06
TRM12Q04235 NAS2YIL007C 663 nt8.44□□□□□ -1.06
TRM12Q04235 TIP1YBR067C 633 nt8.43□□□□□ -1.06
TRM12Q04235 MET2YNL277W 1461 nt8.43□□□□□ -1.06
TRM12Q04235 YJL064WYJL064W 396 nt8.42□□□□□ -1.06
TRM12Q04235 SWT21YNL187W 1074 nt8.42□□□□□ -1.06
TRM12Q04235 YRF1-2YER190W 5046 nt8.42□□□□□ -1.06
TRM12Q04235 KEL3YPL263C 1956 nt8.41□□□□□ -1.06
TRM12Q04235 RPC31YNL151C 756 nt8.41□□□□□ -1.06
TRM12Q04235 AMF1YOR378W 1548 nt8.4□□□□□ -1.06
TRM12Q04235 YMR265CYMR265C 1386 nt8.4□□□□□ -1.06
TRM12Q04235 TPC1YGR096W 945 nt8.4□□□□□ -1.06
TRM12Q04235 PCP1YGR101W 1041 nt8.4□□□□□ -1.06
TRM12Q04235 PUP1YOR157C 786 nt8.4□□□□□ -1.06
TRM12Q04235 RIM2YBR192W 1134 nt8.4□□□□□ -1.06
TRM12Q04235 ENO2YHR174W 1314 nt8.39□□□□□ -1.07
TRM12Q04235 KRR1YCL059C 951 nt8.39□□□□□ -1.07
TRM12Q04235 SNX3YOR357C 489 nt8.39□□□□□ -1.07
TRM12Q04235 MET1YKR069W 1782 nt8.38□□□□□ -1.07
TRM12Q04235 AGP3YFL055W 1677 nt8.38□□□□□ -1.07
TRM12Q04235 PAU19YMR325W 375 nt8.38□□□□□ -1.07
TRM12Q04235 CRC1YOR100C 984 nt8.37□□□□□ -1.07
TRM12Q04235 HAP5YOR358W 729 nt8.37□□□□□ -1.07
TRM12Q04235 DPL1YDR294C 1770 nt8.37□□□□□ -1.07
TRM12Q04235 YKL053WYKL053W 375 nt8.36□□□□□ -1.07
TRM12Q04235 SPE2YOL052C 1191 nt8.36□□□□□ -1.07
TRM12Q04235 IGD1YFR017C 588 nt8.35□□□□□ -1.07
TRM12Q04235 KRE1YNL322C 942 nt8.34□□□□□ -1.07
TRM12Q04235 THP3YPR045C 1413 nt8.32□□□□□ -1.08
TRM12Q04235 NAM8YHR086W 1572 nt8.31□□□□□ -1.08
TRM12Q04235 SFP1YLR403W 2052 nt8.31□□□□□ -1.08
TRM12Q04235 LEU4YNL104C 1860 nt8.31□□□□□ -1.08
TRM12Q04235 NBA1YOL070C 1506 nt8.3□□□□□ -1.08
TRM12Q04235 INH1YDL181W 258 nt8.3□□□□□ -1.08
TRM12Q04235 LEU2YCL018W 1095 nt8.3□□□□□ -1.08
TRM12Q04235 FRE6YLL051C 2139 nt8.29□□□□□ -1.08
TRM12Q04235 GID7YCL039W 2238 nt8.28□□□□□ -1.08
TRM12Q04235 RPN14YGL004C 1254 nt8.28□□□□□ -1.08
TRM12Q04235 PHB2YGR231C 933 nt8.28□□□□□ -1.08
TRM12Q04235 ADH3YMR083W 1128 nt8.28□□□□□ -1.08
TRM12Q04235 snR31snR31 225 nt8.28□□□□□ -1.08
TRM12Q04235 TPO4YOR273C 1980 nt8.28□□□□□ -1.08
TRM12Q04235 KGD2YDR148C 1392 nt8.27□□□□□ -1.09
TRM12Q04235 SAN1YDR143C 1833 nt8.26□□□□□ -1.09
TRM12Q04235 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt8.26□□□□□ -1.09
TRM12Q04235 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt8.26□□□□□ -1.09
TRM12Q04235 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt8.26□□□□□ -1.09
TRM12Q04235 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt8.26□□□□□ -1.09
TRM12Q04235 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt8.26□□□□□ -1.09
TRM12Q04235 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt8.26□□□□□ -1.09
TRM12Q04235 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt8.26□□□□□ -1.09
TRM12Q04235 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt8.26□□□□□ -1.09
TRM12Q04235 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt8.26□□□□□ -1.09
TRM12Q04235 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.2 ms