Protein–RNA interactions for Protein: P63173

RPL38, 60S ribosomal protein L38, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL38P63173 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL38P63173 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL38P63173 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL38P63173 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL38P63173 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL38P63173 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPL38P63173 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPL38P63173 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPL38P63173 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPL38P63173 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPL38P63173 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPL38P63173 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL38P63173 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL38P63173 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL38P63173 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL38P63173 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL38P63173 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL38P63173 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL38P63173 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL38P63173 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL38P63173 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL38P63173 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL38P63173 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL38P63173 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL38P63173 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL38P63173 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL38P63173 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL38P63173 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPL38P63173 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPL38P63173 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPL38P63173 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL38P63173 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL38P63173 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL38P63173 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPL38P63173 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPL38P63173 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPL38P63173 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPL38P63173 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPL38P63173 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPL38P63173 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPL38P63173 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPL38P63173 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPL38P63173 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPL38P63173 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPL38P63173 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPL38P63173 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL38P63173 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL38P63173 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL38P63173 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL38P63173 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL38P63173 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPL38P63173 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPL38P63173 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RPL38P63173 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL38P63173 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL38P63173 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL38P63173 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL38P63173 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL38P63173 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL38P63173 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL38P63173 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPL38P63173 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL38P63173 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL38P63173 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL38P63173 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPL38P63173 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPL38P63173 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RPL38P63173 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPL38P63173 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL38P63173 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL38P63173 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL38P63173 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL38P63173 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL38P63173 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL38P63173 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL38P63173 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPL38P63173 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RPL38P63173 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPL38P63173 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL38P63173 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL38P63173 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL38P63173 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL38P63173 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL38P63173 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL38P63173 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL38P63173 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL38P63173 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL38P63173 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL38P63173 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPL38P63173 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPL38P63173 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPL38P63173 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPL38P63173 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPL38P63173 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPL38P63173 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPL38P63173 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPL38P63173 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPL38P63173 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPL38P63173 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPL38P63173 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms