Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DEFA3P59666 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DEFA3P59666 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
DEFA3P59666 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEFA3P59666 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEFA3P59666 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEFA3P59666 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEFA3P59666 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DEFA3P59666 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEFA3P59666 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEFA3P59666 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEFA3P59666 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEFA3P59666 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DEFA3P59666 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DEFA3P59666 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DEFA3P59666 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DEFA3P59666 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DEFA3P59666 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEFA3P59666 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEFA3P59666 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEFA3P59666 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEFA3P59666 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEFA3P59666 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEFA3P59666 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEFA3P59666 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEFA3P59666 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEFA3P59666 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEFA3P59666 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEFA3P59666 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEFA3P59666 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEFA3P59666 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEFA3P59666 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEFA3P59666 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEFA3P59666 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEFA3P59666 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEFA3P59666 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEFA3P59666 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEFA3P59666 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEFA3P59666 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEFA3P59666 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEFA3P59666 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEFA3P59666 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEFA3P59666 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEFA3P59666 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEFA3P59666 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEFA3P59666 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEFA3P59666 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DEFA3P59666 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEFA3P59666 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DEFA3P59666 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEFA3P59666 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEFA3P59666 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEFA3P59666 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEFA3P59666 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEFA3P59666 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEFA3P59666 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEFA3P59666 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEFA3P59666 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEFA3P59666 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DEFA3P59666 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DEFA3P59666 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DEFA3P59666 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DEFA3P59666 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DEFA3P59666 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEFA3P59666 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEFA3P59666 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEFA3P59666 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DEFA3P59666 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DEFA3P59666 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DEFA3P59666 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DEFA3P59666 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DEFA3P59666 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DEFA3P59666 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DEFA3P59666 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DEFA3P59666 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DEFA3P59666 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DEFA3P59666 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DEFA3P59666 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DEFA3P59666 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DEFA3P59666 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DEFA3P59666 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEFA3P59666 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEFA3P59666 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DEFA3P59666 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DEFA3P59666 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DEFA3P59666 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DEFA3P59666 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEFA3P59666 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEFA3P59666 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEFA3P59666 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEFA3P59666 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEFA3P59666 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEFA3P59666 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEFA3P59666 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEFA3P59666 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEFA3P59666 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEFA3P59666 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEFA3P59666 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEFA3P59666 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEFA3P59666 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms