Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DEFA1P59665 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DEFA1P59665 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
DEFA1P59665 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEFA1P59665 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEFA1P59665 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEFA1P59665 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEFA1P59665 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DEFA1P59665 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEFA1P59665 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEFA1P59665 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEFA1P59665 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEFA1P59665 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DEFA1P59665 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DEFA1P59665 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DEFA1P59665 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DEFA1P59665 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DEFA1P59665 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEFA1P59665 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEFA1P59665 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEFA1P59665 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEFA1P59665 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEFA1P59665 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEFA1P59665 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEFA1P59665 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEFA1P59665 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEFA1P59665 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEFA1P59665 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEFA1P59665 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEFA1P59665 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEFA1P59665 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEFA1P59665 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEFA1P59665 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEFA1P59665 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEFA1P59665 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEFA1P59665 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEFA1P59665 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEFA1P59665 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEFA1P59665 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEFA1P59665 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEFA1P59665 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEFA1P59665 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEFA1P59665 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEFA1P59665 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEFA1P59665 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEFA1P59665 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEFA1P59665 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DEFA1P59665 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEFA1P59665 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DEFA1P59665 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEFA1P59665 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEFA1P59665 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEFA1P59665 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEFA1P59665 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEFA1P59665 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEFA1P59665 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEFA1P59665 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEFA1P59665 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEFA1P59665 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DEFA1P59665 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DEFA1P59665 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DEFA1P59665 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DEFA1P59665 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DEFA1P59665 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEFA1P59665 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEFA1P59665 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEFA1P59665 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DEFA1P59665 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DEFA1P59665 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DEFA1P59665 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DEFA1P59665 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DEFA1P59665 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DEFA1P59665 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DEFA1P59665 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DEFA1P59665 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DEFA1P59665 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DEFA1P59665 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DEFA1P59665 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DEFA1P59665 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DEFA1P59665 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DEFA1P59665 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEFA1P59665 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEFA1P59665 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DEFA1P59665 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DEFA1P59665 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DEFA1P59665 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DEFA1P59665 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEFA1P59665 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEFA1P59665 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEFA1P59665 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEFA1P59665 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEFA1P59665 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEFA1P59665 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEFA1P59665 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEFA1P59665 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEFA1P59665 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEFA1P59665 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEFA1P59665 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEFA1P59665 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEFA1P59665 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms