Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PMS1P54277 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PMS1P54277 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PMS1P54277 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PMS1P54277 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PMS1P54277 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PMS1P54277 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PMS1P54277 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PMS1P54277 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PMS1P54277 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PMS1P54277 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PMS1P54277 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PMS1P54277 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PMS1P54277 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PMS1P54277 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PMS1P54277 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PMS1P54277 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PMS1P54277 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PMS1P54277 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PMS1P54277 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PMS1P54277 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PMS1P54277 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PMS1P54277 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PMS1P54277 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PMS1P54277 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PMS1P54277 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PMS1P54277 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PMS1P54277 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PMS1P54277 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PMS1P54277 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PMS1P54277 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PMS1P54277 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PMS1P54277 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PMS1P54277 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PMS1P54277 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PMS1P54277 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PMS1P54277 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PMS1P54277 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PMS1P54277 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PMS1P54277 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PMS1P54277 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PMS1P54277 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PMS1P54277 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PMS1P54277 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PMS1P54277 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PMS1P54277 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PMS1P54277 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PMS1P54277 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PMS1P54277 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PMS1P54277 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PMS1P54277 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PMS1P54277 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PMS1P54277 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PMS1P54277 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PMS1P54277 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PMS1P54277 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PMS1P54277 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PMS1P54277 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PMS1P54277 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PMS1P54277 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PMS1P54277 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PMS1P54277 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PMS1P54277 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PMS1P54277 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PMS1P54277 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PMS1P54277 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PMS1P54277 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PMS1P54277 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PMS1P54277 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PMS1P54277 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PMS1P54277 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PMS1P54277 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PMS1P54277 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PMS1P54277 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PMS1P54277 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PMS1P54277 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PMS1P54277 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PMS1P54277 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PMS1P54277 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PMS1P54277 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PMS1P54277 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PMS1P54277 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PMS1P54277 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PMS1P54277 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PMS1P54277 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PMS1P54277 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PMS1P54277 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PMS1P54277 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PMS1P54277 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PMS1P54277 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PMS1P54277 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PMS1P54277 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PMS1P54277 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PMS1P54277 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PMS1P54277 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PMS1P54277 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PMS1P54277 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PMS1P54277 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PMS1P54277 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PMS1P54277 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms