Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PGGT1BP53609 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PGGT1BP53609 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PGGT1BP53609 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PGGT1BP53609 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PGGT1BP53609 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PGGT1BP53609 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PGGT1BP53609 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PGGT1BP53609 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PGGT1BP53609 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PGGT1BP53609 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PGGT1BP53609 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PGGT1BP53609 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PGGT1BP53609 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PGGT1BP53609 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PGGT1BP53609 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PGGT1BP53609 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PGGT1BP53609 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PGGT1BP53609 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PGGT1BP53609 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PGGT1BP53609 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PGGT1BP53609 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PGGT1BP53609 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PGGT1BP53609 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PGGT1BP53609 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PGGT1BP53609 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PGGT1BP53609 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PGGT1BP53609 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PGGT1BP53609 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PGGT1BP53609 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PGGT1BP53609 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PGGT1BP53609 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PGGT1BP53609 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PGGT1BP53609 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGGT1BP53609 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGGT1BP53609 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGGT1BP53609 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGGT1BP53609 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PGGT1BP53609 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PGGT1BP53609 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PGGT1BP53609 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PGGT1BP53609 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PGGT1BP53609 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGGT1BP53609 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGGT1BP53609 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PGGT1BP53609 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGGT1BP53609 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGGT1BP53609 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGGT1BP53609 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PGGT1BP53609 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PGGT1BP53609 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PGGT1BP53609 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PGGT1BP53609 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PGGT1BP53609 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PGGT1BP53609 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PGGT1BP53609 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PGGT1BP53609 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PGGT1BP53609 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PGGT1BP53609 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PGGT1BP53609 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PGGT1BP53609 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PGGT1BP53609 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PGGT1BP53609 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PGGT1BP53609 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PGGT1BP53609 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PGGT1BP53609 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PGGT1BP53609 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PGGT1BP53609 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PGGT1BP53609 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PGGT1BP53609 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PGGT1BP53609 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PGGT1BP53609 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PGGT1BP53609 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PGGT1BP53609 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PGGT1BP53609 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PGGT1BP53609 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PGGT1BP53609 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PGGT1BP53609 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PGGT1BP53609 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PGGT1BP53609 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGGT1BP53609 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGGT1BP53609 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGGT1BP53609 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGGT1BP53609 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGGT1BP53609 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGGT1BP53609 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGGT1BP53609 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PGGT1BP53609 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PGGT1BP53609 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGGT1BP53609 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGGT1BP53609 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PGGT1BP53609 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PGGT1BP53609 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PGGT1BP53609 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PGGT1BP53609 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PGGT1BP53609 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PGGT1BP53609 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PGGT1BP53609 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
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