Protein–RNA interactions for Protein: P49840

GSK3A, Glycogen synthase kinase-3 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3AP49840 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSK3AP49840 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSK3AP49840 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSK3AP49840 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSK3AP49840 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSK3AP49840 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSK3AP49840 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSK3AP49840 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSK3AP49840 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSK3AP49840 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSK3AP49840 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSK3AP49840 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSK3AP49840 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSK3AP49840 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSK3AP49840 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSK3AP49840 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSK3AP49840 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSK3AP49840 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSK3AP49840 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSK3AP49840 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSK3AP49840 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSK3AP49840 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSK3AP49840 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSK3AP49840 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSK3AP49840 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSK3AP49840 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSK3AP49840 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSK3AP49840 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSK3AP49840 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSK3AP49840 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSK3AP49840 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSK3AP49840 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSK3AP49840 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSK3AP49840 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSK3AP49840 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSK3AP49840 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSK3AP49840 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GSK3AP49840 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSK3AP49840 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSK3AP49840 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSK3AP49840 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSK3AP49840 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSK3AP49840 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSK3AP49840 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSK3AP49840 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSK3AP49840 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSK3AP49840 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSK3AP49840 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSK3AP49840 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSK3AP49840 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSK3AP49840 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GSK3AP49840 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSK3AP49840 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSK3AP49840 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSK3AP49840 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSK3AP49840 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSK3AP49840 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSK3AP49840 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSK3AP49840 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSK3AP49840 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSK3AP49840 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSK3AP49840 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSK3AP49840 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSK3AP49840 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSK3AP49840 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSK3AP49840 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSK3AP49840 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSK3AP49840 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSK3AP49840 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSK3AP49840 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSK3AP49840 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSK3AP49840 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSK3AP49840 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSK3AP49840 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSK3AP49840 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSK3AP49840 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSK3AP49840 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GSK3AP49840 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSK3AP49840 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSK3AP49840 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GSK3AP49840 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSK3AP49840 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSK3AP49840 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSK3AP49840 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSK3AP49840 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSK3AP49840 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSK3AP49840 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSK3AP49840 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSK3AP49840 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSK3AP49840 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSK3AP49840 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSK3AP49840 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSK3AP49840 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSK3AP49840 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSK3AP49840 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSK3AP49840 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSK3AP49840 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSK3AP49840 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GSK3AP49840 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSK3AP49840 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms