Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUFMP49411 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUFMP49411 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUFMP49411 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUFMP49411 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUFMP49411 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUFMP49411 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUFMP49411 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUFMP49411 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUFMP49411 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TUFMP49411 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TUFMP49411 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUFMP49411 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TUFMP49411 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUFMP49411 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUFMP49411 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUFMP49411 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUFMP49411 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUFMP49411 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TUFMP49411 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TUFMP49411 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TUFMP49411 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TUFMP49411 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TUFMP49411 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TUFMP49411 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TUFMP49411 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TUFMP49411 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TUFMP49411 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TUFMP49411 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TUFMP49411 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TUFMP49411 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUFMP49411 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUFMP49411 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TUFMP49411 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TUFMP49411 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUFMP49411 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUFMP49411 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUFMP49411 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TUFMP49411 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TUFMP49411 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUFMP49411 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUFMP49411 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TUFMP49411 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TUFMP49411 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUFMP49411 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUFMP49411 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUFMP49411 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUFMP49411 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUFMP49411 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUFMP49411 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUFMP49411 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUFMP49411 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUFMP49411 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TUFMP49411 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TUFMP49411 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TUFMP49411 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TUFMP49411 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUFMP49411 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUFMP49411 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUFMP49411 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUFMP49411 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUFMP49411 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUFMP49411 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUFMP49411 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TUFMP49411 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUFMP49411 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUFMP49411 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUFMP49411 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUFMP49411 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUFMP49411 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUFMP49411 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TUFMP49411 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TUFMP49411 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TUFMP49411 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TUFMP49411 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TUFMP49411 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TUFMP49411 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TUFMP49411 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TUFMP49411 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TUFMP49411 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TUFMP49411 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TUFMP49411 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TUFMP49411 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TUFMP49411 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TUFMP49411 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TUFMP49411 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TUFMP49411 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TUFMP49411 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TUFMP49411 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TUFMP49411 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TUFMP49411 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TUFMP49411 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TUFMP49411 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TUFMP49411 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TUFMP49411 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TUFMP49411 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TUFMP49411 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TUFMP49411 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TUFMP49411 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TUFMP49411 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms