Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FNTAP49354 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FNTAP49354 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FNTAP49354 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FNTAP49354 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FNTAP49354 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FNTAP49354 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FNTAP49354 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FNTAP49354 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FNTAP49354 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
FNTAP49354 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FNTAP49354 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FNTAP49354 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FNTAP49354 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FNTAP49354 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FNTAP49354 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FNTAP49354 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FNTAP49354 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FNTAP49354 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FNTAP49354 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FNTAP49354 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FNTAP49354 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FNTAP49354 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FNTAP49354 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FNTAP49354 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FNTAP49354 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FNTAP49354 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FNTAP49354 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FNTAP49354 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FNTAP49354 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FNTAP49354 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FNTAP49354 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FNTAP49354 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FNTAP49354 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FNTAP49354 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FNTAP49354 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FNTAP49354 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
FNTAP49354 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FNTAP49354 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FNTAP49354 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FNTAP49354 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FNTAP49354 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FNTAP49354 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FNTAP49354 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FNTAP49354 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FNTAP49354 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FNTAP49354 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FNTAP49354 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FNTAP49354 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
FNTAP49354 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FNTAP49354 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FNTAP49354 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FNTAP49354 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FNTAP49354 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FNTAP49354 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FNTAP49354 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FNTAP49354 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FNTAP49354 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FNTAP49354 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FNTAP49354 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FNTAP49354 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FNTAP49354 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FNTAP49354 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FNTAP49354 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FNTAP49354 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FNTAP49354 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FNTAP49354 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FNTAP49354 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FNTAP49354 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FNTAP49354 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FNTAP49354 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FNTAP49354 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FNTAP49354 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FNTAP49354 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FNTAP49354 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FNTAP49354 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FNTAP49354 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FNTAP49354 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FNTAP49354 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FNTAP49354 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FNTAP49354 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FNTAP49354 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FNTAP49354 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FNTAP49354 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FNTAP49354 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FNTAP49354 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FNTAP49354 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FNTAP49354 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FNTAP49354 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FNTAP49354 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FNTAP49354 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FNTAP49354 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FNTAP49354 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FNTAP49354 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FNTAP49354 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FNTAP49354 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FNTAP49354 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FNTAP49354 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FNTAP49354 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FNTAP49354 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms