Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SSR1P43307 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SSR1P43307 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSR1P43307 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SSR1P43307 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSR1P43307 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSR1P43307 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSR1P43307 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSR1P43307 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSR1P43307 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSR1P43307 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSR1P43307 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSR1P43307 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSR1P43307 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSR1P43307 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSR1P43307 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSR1P43307 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SSR1P43307 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SSR1P43307 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SSR1P43307 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SSR1P43307 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SSR1P43307 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SSR1P43307 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SSR1P43307 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SSR1P43307 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SSR1P43307 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SSR1P43307 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SSR1P43307 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SSR1P43307 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SSR1P43307 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SSR1P43307 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SSR1P43307 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SSR1P43307 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SSR1P43307 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SSR1P43307 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSR1P43307 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSR1P43307 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSR1P43307 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSR1P43307 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSR1P43307 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSR1P43307 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSR1P43307 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSR1P43307 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSR1P43307 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSR1P43307 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSR1P43307 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSR1P43307 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSR1P43307 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSR1P43307 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SSR1P43307 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SSR1P43307 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SSR1P43307 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSR1P43307 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSR1P43307 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSR1P43307 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSR1P43307 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSR1P43307 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSR1P43307 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSR1P43307 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSR1P43307 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSR1P43307 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSR1P43307 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSR1P43307 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSR1P43307 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SSR1P43307 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SSR1P43307 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SSR1P43307 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SSR1P43307 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SSR1P43307 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SSR1P43307 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SSR1P43307 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SSR1P43307 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSR1P43307 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSR1P43307 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSR1P43307 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSR1P43307 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSR1P43307 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSR1P43307 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSR1P43307 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSR1P43307 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSR1P43307 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSR1P43307 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSR1P43307 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSR1P43307 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSR1P43307 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSR1P43307 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSR1P43307 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SSR1P43307 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SSR1P43307 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SSR1P43307 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SSR1P43307 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SSR1P43307 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SSR1P43307 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SSR1P43307 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SSR1P43307 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SSR1P43307 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SSR1P43307 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SSR1P43307 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SSR1P43307 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SSR1P43307 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms