Protein–RNA interactions for Protein: P40547

VID28, Vacuolar import and degradation protein 28, yeastyeast

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID28P40547 YGL114WYGL114W 2178 nt10.1□□□□□ -0.79
VID28P40547 OPI3YJR073C 621 nt10.1□□□□□ -0.79
VID28P40547 MHF1YOL086W-A 273 nt10.1□□□□□ -0.79
VID28P40547 SPS100YHR139C 981 nt10.09□□□□□ -0.79
VID28P40547 YKL133CYKL133C 1392 nt10.08□□□□□ -0.8
VID28P40547 HIS2YFR025C 1008 nt10.07□□□□□ -0.8
VID28P40547 YJR114WYJR114W 393 nt10.07□□□□□ -0.8
VID28P40547 TVP23YDR084C 600 nt10.06□□□□□ -0.8
VID28P40547 TAF13YML098W 504 nt10.05□□□□□ -0.8
VID28P40547 LSR1LSR1 1175 nt10.05□□□□□ -0.8
VID28P40547 YMR262WYMR262W 942 nt10.05□□□□□ -0.8
VID28P40547 NME1NME1 340 nt10.05□□□□□ -0.8
VID28P40547 POT1YIL160C 1254 nt10.04□□□□□ -0.8
VID28P40547 SSL2YIL143C 2532 nt10.04□□□□□ -0.8
VID28P40547 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt10.03□□□□□ -0.8
VID28P40547 NIF3YGL221C 867 nt10.02□□□□□ -0.81
VID28P40547 ESS1YJR017C 513 nt10.01□□□□□ -0.81
VID28P40547 APS2YJR058C 444 nt10.01□□□□□ -0.81
VID28P40547 YNR064CYNR064C 873 nt10.01□□□□□ -0.81
VID28P40547 MET2YNL277W 1461 nt10□□□□□ -0.81
VID28P40547 ELO1YJL196C 933 nt10□□□□□ -0.81
VID28P40547 PGC1YPL206C 966 nt10□□□□□ -0.81
VID28P40547 MAE1YKL029C 2010 nt9.99□□□□□ -0.81
VID28P40547 SFL1YOR140W 2301 nt9.99□□□□□ -0.81
VID28P40547 SUV3YPL029W 2214 nt9.98□□□□□ -0.81
VID28P40547 PAU5YFL020C 369 nt9.97□□□□□ -0.81
VID28P40547 ABZ2YMR289W 1125 nt9.97□□□□□ -0.81
VID28P40547 ODC1YPL134C 933 nt9.97□□□□□ -0.81
VID28P40547 SFP1YLR403W 2052 nt9.96□□□□□ -0.81
VID28P40547 TUB4YLR212C 1422 nt9.96□□□□□ -0.82
VID28P40547 VMA11YPL234C 495 nt9.95□□□□□ -0.82
VID28P40547 GSF2YML048W 1212 nt9.94□□□□□ -0.82
VID28P40547 YMR209CYMR209C 1374 nt9.92□□□□□ -0.82
VID28P40547 RPD3YNL330C 1302 nt9.92□□□□□ -0.82
VID28P40547 CWP2YKL096W-A 279 nt9.92□□□□□ -0.82
VID28P40547 SWT21YNL187W 1074 nt9.92□□□□□ -0.82
VID28P40547 KEL3YPL263C 1956 nt9.92□□□□□ -0.82
VID28P40547 CDD1YLR245C 429 nt9.91□□□□□ -0.82
VID28P40547 TIP1YBR067C 633 nt9.91□□□□□ -0.82
VID28P40547 YMR265CYMR265C 1386 nt9.9□□□□□ -0.82
VID28P40547 YBR232CYBR232C 360 nt9.9□□□□□ -0.82
VID28P40547 NAS2YIL007C 663 nt9.89□□□□□ -0.83
VID28P40547 STP3YLR375W 1032 nt9.89□□□□□ -0.83
VID28P40547 PCP1YGR101W 1041 nt9.88□□□□□ -0.83
VID28P40547 SNX3YOR357C 489 nt9.88□□□□□ -0.83
VID28P40547 MET1YKR069W 1782 nt9.88□□□□□ -0.83
VID28P40547 AMF1YOR378W 1548 nt9.87□□□□□ -0.83
VID28P40547 HAP5YOR358W 729 nt9.87□□□□□ -0.83
VID28P40547 SEN2YLR105C 1134 nt9.86□□□□□ -0.83
VID28P40547 TPC1YGR096W 945 nt9.85□□□□□ -0.83
VID28P40547 NAP1YKR048C 1254 nt9.85□□□□□ -0.83
VID28P40547 CRC1YOR100C 984 nt9.85□□□□□ -0.83
VID28P40547 DPL1YDR294C 1770 nt9.85□□□□□ -0.83
VID28P40547 ENO2YHR174W 1314 nt9.83□□□□□ -0.84
VID28P40547 TIM44YIL022W 1296 nt9.82□□□□□ -0.84
VID28P40547 YKL053WYKL053W 375 nt9.82□□□□□ -0.84
VID28P40547 RIM2YBR192W 1134 nt9.82□□□□□ -0.84
VID28P40547 RPC31YNL151C 756 nt9.81□□□□□ -0.84
VID28P40547 MDM35YKL053C-A 261 nt9.8□□□□□ -0.84
VID28P40547 ACO2YJL200C 2370 nt9.8□□□□□ -0.84
VID28P40547 DMA2YNL116W 1569 nt9.8□□□□□ -0.84
VID28P40547 THP3YPR045C 1413 nt9.79□□□□□ -0.84
VID28P40547 PAR32YDL173W 888 nt9.78□□□□□ -0.84
VID28P40547 SPE2YOL052C 1191 nt9.78□□□□□ -0.84
VID28P40547 NPP1YCR026C 2229 nt9.77□□□□□ -0.85
VID28P40547 IGD1YFR017C 588 nt9.77□□□□□ -0.85
VID28P40547 RPN14YGL004C 1254 nt9.77□□□□□ -0.85
VID28P40547 PUP1YOR157C 786 nt9.77□□□□□ -0.85
VID28P40547 snR31snR31 225 nt9.77□□□□□ -0.85
VID28P40547 NAM8YHR086W 1572 nt9.76□□□□□ -0.85
VID28P40547 LEU2YCL018W 1095 nt9.75□□□□□ -0.85
VID28P40547 SAN1YDR143C 1833 nt9.75□□□□□ -0.85
VID28P40547 KGD2YDR148C 1392 nt9.75□□□□□ -0.85
VID28P40547 KRR1YCL059C 951 nt9.74□□□□□ -0.85
VID28P40547 YHR218WYHR218W 1812 nt9.73□□□□□ -0.85
VID28P40547 PHB2YGR231C 933 nt9.72□□□□□ -0.85
VID28P40547 KRE1YNL322C 942 nt9.72□□□□□ -0.85
VID28P40547 HXT10YFL011W 1641 nt9.71□□□□□ -0.85
VID28P40547 TPO4YOR273C 1980 nt9.71□□□□□ -0.86
VID28P40547 YJL064WYJL064W 396 nt9.7□□□□□ -0.86
VID28P40547 FSH2YMR222C 672 nt9.7□□□□□ -0.86
VID28P40547 HMG2YLR450W 3138 nt9.7□□□□□ -0.86
VID28P40547 ADH3YMR083W 1128 nt9.69□□□□□ -0.86
VID28P40547 LEU4YNL104C 1860 nt9.69□□□□□ -0.86
VID28P40547 PSD1YNL169C 1503 nt9.68□□□□□ -0.86
VID28P40547 SRP54YPR088C 1626 nt9.67□□□□□ -0.86
VID28P40547 REX2YLR059C 810 nt9.67□□□□□ -0.86
VID28P40547 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt9.66□□□□□ -0.86
VID28P40547 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt9.66□□□□□ -0.86
VID28P40547 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt9.66□□□□□ -0.86
VID28P40547 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt9.66□□□□□ -0.86
VID28P40547 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt9.66□□□□□ -0.86
VID28P40547 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt9.66□□□□□ -0.86
VID28P40547 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt9.66□□□□□ -0.86
VID28P40547 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt9.66□□□□□ -0.86
VID28P40547 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt9.66□□□□□ -0.86
VID28P40547 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt9.66□□□□□ -0.86
VID28P40547 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt9.66□□□□□ -0.86
VID28P40547 YKR012CYKR012C 378 nt9.65□□□□□ -0.86
VID28P40547 SDS24YBR214W 1584 nt9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.1 ms