Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 IMO32YGR031W 1029 nt8.82□□□□□ -1
SEC28P40509 MRS6YOR370C 1812 nt8.8□□□□□ -1
SEC28P40509 ADE8YDR408C 645 nt8.8□□□□□ -1
SEC28P40509 FUN14YAL008W 597 nt8.8□□□□□ -1
SEC28P40509 TIP1YBR067C 633 nt8.8□□□□□ -1
SEC28P40509 YMR209CYMR209C 1374 nt8.8□□□□□ -1
SEC28P40509 DLD3YEL071W 1491 nt8.78□□□□□ -1
SEC28P40509 THI72YOR192C 1800 nt8.78□□□□□ -1
SEC28P40509 RRT8YOL048C 1029 nt8.78□□□□□ -1
SEC28P40509 CCT5YJR064W 1689 nt8.78□□□□□ -1
SEC28P40509 DAK2YFL053W 1776 nt8.77□□□□□ -1.01
SEC28P40509 YEL008WYEL008W 381 nt8.77□□□□□ -1.01
SEC28P40509 YDR306CYDR306C 1437 nt8.75□□□□□ -1.01
SEC28P40509 YJR114WYJR114W 393 nt8.75□□□□□ -1.01
SEC28P40509 LSR1LSR1 1175 nt8.75□□□□□ -1.01
SEC28P40509 RPD3YNL330C 1302 nt8.75□□□□□ -1.01
SEC28P40509 YHR219WYHR219W 1875 nt8.74□□□□□ -1.01
SEC28P40509 ZAP1YJL056C 2643 nt8.74□□□□□ -1.01
SEC28P40509 TIM44YIL022W 1296 nt8.74□□□□□ -1.01
SEC28P40509 IML3YBR107C 738 nt8.74□□□□□ -1.01
SEC28P40509 ITR2YOL103W 1830 nt8.73□□□□□ -1.01
SEC28P40509 SNZ1YMR096W 894 nt8.73□□□□□ -1.01
SEC28P40509 ODC1YPL134C 933 nt8.72□□□□□ -1.01
SEC28P40509 VMA11YPL234C 495 nt8.72□□□□□ -1.01
SEC28P40509 YPR126CYPR126C 309 nt8.72□□□□□ -1.01
SEC28P40509 TAF13YML098W 504 nt8.71□□□□□ -1.02
SEC28P40509 YNR064CYNR064C 873 nt8.71□□□□□ -1.02
SEC28P40509 FRA1YLL029W 2250 nt8.7□□□□□ -1.02
SEC28P40509 SAC7YDR389W 1965 nt8.7□□□□□ -1.02
SEC28P40509 CYT1YOR065W 930 nt8.7□□□□□ -1.02
SEC28P40509 CTI6YPL181W 1521 nt8.7□□□□□ -1.02
SEC28P40509 ELO1YJL196C 933 nt8.69□□□□□ -1.02
SEC28P40509 STE4YOR212W 1272 nt8.69□□□□□ -1.02
SEC28P40509 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8.68□□□□□ -1.02
SEC28P40509 SPS100YHR139C 981 nt8.68□□□□□ -1.02
SEC28P40509 SSL2YIL143C 2532 nt8.67□□□□□ -1.02
SEC28P40509 DMA2YNL116W 1569 nt8.67□□□□□ -1.02
SEC28P40509 SNX3YOR357C 489 nt8.67□□□□□ -1.02
SEC28P40509 TVP23YDR084C 600 nt8.66□□□□□ -1.02
SEC28P40509 PSD1YNL169C 1503 nt8.65□□□□□ -1.02
SEC28P40509 ENO2YHR174W 1314 nt8.65□□□□□ -1.02
SEC28P40509 OPI3YJR073C 621 nt8.65□□□□□ -1.02
SEC28P40509 CWP2YKL096W-A 279 nt8.65□□□□□ -1.02
SEC28P40509 MHF1YOL086W-A 273 nt8.65□□□□□ -1.02
SEC28P40509 ACO2YJL200C 2370 nt8.65□□□□□ -1.02
SEC28P40509 RPN14YGL004C 1254 nt8.64□□□□□ -1.03
SEC28P40509 Q0010Q0010 387 nt8.64□□□□□ -1.03
SEC28P40509 KEL3YPL263C 1956 nt8.64□□□□□ -1.03
SEC28P40509 ABZ2YMR289W 1125 nt8.63□□□□□ -1.03
SEC28P40509 CPD1YGR247W 720 nt8.62□□□□□ -1.03
SEC28P40509 POT1YIL160C 1254 nt8.62□□□□□ -1.03
SEC28P40509 MDM35YKL053C-A 261 nt8.62□□□□□ -1.03
SEC28P40509 YMR265CYMR265C 1386 nt8.61□□□□□ -1.03
SEC28P40509 HAP5YOR358W 729 nt8.61□□□□□ -1.03
SEC28P40509 YMR262WYMR262W 942 nt8.6□□□□□ -1.03
SEC28P40509 snR31snR31 225 nt8.6□□□□□ -1.03
SEC28P40509 KRR1YCL059C 951 nt8.59□□□□□ -1.03
SEC28P40509 RPC31YNL151C 756 nt8.59□□□□□ -1.03
SEC28P40509 PUS7YOR243C 2031 nt8.59□□□□□ -1.03
SEC28P40509 AMF1YOR378W 1548 nt8.58□□□□□ -1.04
SEC28P40509 ADH7YCR105W 1086 nt8.57□□□□□ -1.04
SEC28P40509 GNP1YDR508C 1992 nt8.56□□□□□ -1.04
SEC28P40509 YLR349WYLR349W 507 nt8.56□□□□□ -1.04
SEC28P40509 KRE1YNL322C 942 nt8.55□□□□□ -1.04
SEC28P40509 SUV3YPL029W 2214 nt8.55□□□□□ -1.04
SEC28P40509 PCP1YGR101W 1041 nt8.54□□□□□ -1.04
SEC28P40509 PAU15YIR041W 375 nt8.53□□□□□ -1.04
SEC28P40509 RIM2YBR192W 1134 nt8.53□□□□□ -1.04
SEC28P40509 TPC1YGR096W 945 nt8.52□□□□□ -1.05
SEC28P40509 GSF2YML048W 1212 nt8.52□□□□□ -1.05
SEC28P40509 HXT10YFL011W 1641 nt8.51□□□□□ -1.05
SEC28P40509 MET1YKR069W 1782 nt8.51□□□□□ -1.05
SEC28P40509 CRC1YOR100C 984 nt8.51□□□□□ -1.05
SEC28P40509 INH1YDL181W 258 nt8.5□□□□□ -1.05
SEC28P40509 SWT21YNL187W 1074 nt8.5□□□□□ -1.05
SEC28P40509 SFL1YOR140W 2301 nt8.48□□□□□ -1.05
SEC28P40509 YRF1-2YER190W 5046 nt8.48□□□□□ -1.05
SEC28P40509 LEU2YCL018W 1095 nt8.48□□□□□ -1.05
SEC28P40509 DPL1YDR294C 1770 nt8.48□□□□□ -1.05
SEC28P40509 YHR218WYHR218W 1812 nt8.47□□□□□ -1.05
SEC28P40509 YDR467CYDR467C 327 nt8.47□□□□□ -1.05
SEC28P40509 SPE2YOL052C 1191 nt8.47□□□□□ -1.05
SEC28P40509 TUB4YLR212C 1422 nt8.46□□□□□ -1.05
SEC28P40509 YKL053WYKL053W 375 nt8.46□□□□□ -1.06
SEC28P40509 NSG2YNL156C 900 nt8.46□□□□□ -1.06
SEC28P40509 LEU4YNL104C 1860 nt8.45□□□□□ -1.06
SEC28P40509 RAD51YER095W 1203 nt8.45□□□□□ -1.06
SEC28P40509 PAU5YFL020C 369 nt8.45□□□□□ -1.06
SEC28P40509 NAM8YHR086W 1572 nt8.44□□□□□ -1.06
SEC28P40509 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt8.43□□□□□ -1.06
SEC28P40509 APS2YJR058C 444 nt8.43□□□□□ -1.06
SEC28P40509 NIF3YGL221C 867 nt8.42□□□□□ -1.06
SEC28P40509 KGD2YDR148C 1392 nt8.42□□□□□ -1.06
SEC28P40509 AGP3YFL055W 1677 nt8.42□□□□□ -1.06
SEC28P40509 TOM71YHR117W 1920 nt8.42□□□□□ -1.06
SEC28P40509 YLR173WYLR173W 1827 nt8.41□□□□□ -1.06
SEC28P40509 YJR154WYJR154W 1041 nt8.41□□□□□ -1.06
SEC28P40509 SRP54YPR088C 1626 nt8.4□□□□□ -1.06
SEC28P40509 SBP1YHL034C 885 nt8.4□□□□□ -1.06
SEC28P40509 TPN1YGL186C 1740 nt8.38□□□□□ -1.07
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