Protein–RNA interactions for Protein: P38798

NMD2, Nonsense-mediated mRNA decay protein 2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD2P38798 QDR2YIL121W 1629 nt10.68□□□□□ -0.7
NMD2P38798 DIG1YPL049C 1359 nt10.67□□□□□ -0.7
NMD2P38798 KES1YPL145C 1305 nt10.67□□□□□ -0.7
NMD2P38798 RRT8YOL048C 1029 nt10.67□□□□□ -0.7
NMD2P38798 CTI6YPL181W 1521 nt10.64□□□□□ -0.71
NMD2P38798 ESBP6YNL125C 2022 nt10.63□□□□□ -0.71
NMD2P38798 PAU15YIR041W 375 nt10.63□□□□□ -0.71
NMD2P38798 SGA1YIL099W 1650 nt10.63□□□□□ -0.71
NMD2P38798 ENT4YLL038C 744 nt10.62□□□□□ -0.71
NMD2P38798 ILV2YMR108W 2064 nt10.62□□□□□ -0.71
NMD2P38798 SAC7YDR389W 1965 nt10.61□□□□□ -0.71
NMD2P38798 YDR306CYDR306C 1437 nt10.61□□□□□ -0.71
NMD2P38798 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt10.61□□□□□ -0.71
NMD2P38798 MHF1YOL086W-A 273 nt10.61□□□□□ -0.71
NMD2P38798 IML3YBR107C 738 nt10.61□□□□□ -0.71
NMD2P38798 ADE8YDR408C 645 nt10.6□□□□□ -0.71
NMD2P38798 TAF13YML098W 504 nt10.6□□□□□ -0.71
NMD2P38798 ZAP1YJL056C 2643 nt10.6□□□□□ -0.71
NMD2P38798 YLR046CYLR046C 813 nt10.59□□□□□ -0.71
NMD2P38798 GTB1YDR221W 2109 nt10.58□□□□□ -0.72
NMD2P38798 GID8YMR135C 1368 nt10.57□□□□□ -0.72
NMD2P38798 UGP1YKL035W 1500 nt10.57□□□□□ -0.72
NMD2P38798 SPS100YHR139C 981 nt10.56□□□□□ -0.72
NMD2P38798 DLD3YEL071W 1491 nt10.55□□□□□ -0.72
NMD2P38798 YJR114WYJR114W 393 nt10.54□□□□□ -0.72
NMD2P38798 YMR262WYMR262W 942 nt10.54□□□□□ -0.72
NMD2P38798 POT1YIL160C 1254 nt10.53□□□□□ -0.72
NMD2P38798 OPI3YJR073C 621 nt10.53□□□□□ -0.72
NMD2P38798 MRS6YOR370C 1812 nt10.53□□□□□ -0.72
NMD2P38798 YHR219WYHR219W 1875 nt10.53□□□□□ -0.72
NMD2P38798 ITR2YOL103W 1830 nt10.52□□□□□ -0.73
NMD2P38798 HIS2YFR025C 1008 nt10.52□□□□□ -0.73
NMD2P38798 TVP23YDR084C 600 nt10.51□□□□□ -0.73
NMD2P38798 YKL133CYKL133C 1392 nt10.5□□□□□ -0.73
NMD2P38798 ESS1YJR017C 513 nt10.49□□□□□ -0.73
NMD2P38798 YNR064CYNR064C 873 nt10.49□□□□□ -0.73
NMD2P38798 PAU5YFL020C 369 nt10.48□□□□□ -0.73
NMD2P38798 PGC1YPL206C 966 nt10.48□□□□□ -0.73
NMD2P38798 PUS7YOR243C 2031 nt10.47□□□□□ -0.73
NMD2P38798 YHL008CYHL008C 1884 nt10.47□□□□□ -0.73
NMD2P38798 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt10.46□□□□□ -0.73
NMD2P38798 APS2YJR058C 444 nt10.46□□□□□ -0.73
NMD2P38798 GSF2YML048W 1212 nt10.46□□□□□ -0.73
NMD2P38798 LSR1LSR1 1175 nt10.46□□□□□ -0.73
NMD2P38798 GAL2YLR081W 1725 nt10.45□□□□□ -0.74
NMD2P38798 TUB4YLR212C 1422 nt10.45□□□□□ -0.74
NMD2P38798 NIF3YGL221C 867 nt10.45□□□□□ -0.74
NMD2P38798 ABZ2YMR289W 1125 nt10.45□□□□□ -0.74
NMD2P38798 DTR1YBR180W 1719 nt10.44□□□□□ -0.74
NMD2P38798 ELO1YJL196C 933 nt10.44□□□□□ -0.74
NMD2P38798 PAB1YER165W 1734 nt10.41□□□□□ -0.74
NMD2P38798 STP3YLR375W 1032 nt10.41□□□□□ -0.74
NMD2P38798 VMA11YPL234C 495 nt10.41□□□□□ -0.74
NMD2P38798 HEM14YER014W 1620 nt10.4□□□□□ -0.74
NMD2P38798 YMR209CYMR209C 1374 nt10.4□□□□□ -0.74
NMD2P38798 SSL2YIL143C 2532 nt10.4□□□□□ -0.74
NMD2P38798 YBR232CYBR232C 360 nt10.39□□□□□ -0.75
NMD2P38798 HXK1YFR053C 1458 nt10.38□□□□□ -0.75
NMD2P38798 TIP1YBR067C 633 nt10.38□□□□□ -0.75
NMD2P38798 RFC1YOR217W 2586 nt10.37□□□□□ -0.75
NMD2P38798 KEL3YPL263C 1956 nt10.37□□□□□ -0.75
NMD2P38798 SUV3YPL029W 2214 nt10.37□□□□□ -0.75
NMD2P38798 SFL1YOR140W 2301 nt10.36□□□□□ -0.75
NMD2P38798 RPD3YNL330C 1302 nt10.36□□□□□ -0.75
NMD2P38798 ODC1YPL134C 933 nt10.36□□□□□ -0.75
NMD2P38798 YMR265CYMR265C 1386 nt10.36□□□□□ -0.75
NMD2P38798 PCP1YGR101W 1041 nt10.35□□□□□ -0.75
NMD2P38798 SWT21YNL187W 1074 nt10.35□□□□□ -0.75
NMD2P38798 AMF1YOR378W 1548 nt10.34□□□□□ -0.75
NMD2P38798 CWP2YKL096W-A 279 nt10.34□□□□□ -0.75
NMD2P38798 ENO2YHR174W 1314 nt10.33□□□□□ -0.76
NMD2P38798 HAP5YOR358W 729 nt10.33□□□□□ -0.76
NMD2P38798 SNX3YOR357C 489 nt10.32□□□□□ -0.76
NMD2P38798 ALD5YER073W 1563 nt10.31□□□□□ -0.76
NMD2P38798 PAR32YDL173W 888 nt10.31□□□□□ -0.76
NMD2P38798 NAS2YIL007C 663 nt10.31□□□□□ -0.76
NMD2P38798 CDD1YLR245C 429 nt10.31□□□□□ -0.76
NMD2P38798 TOK1YJL093C 2076 nt10.3□□□□□ -0.76
NMD2P38798 MET1YKR069W 1782 nt10.29□□□□□ -0.76
NMD2P38798 TPC1YGR096W 945 nt10.29□□□□□ -0.76
NMD2P38798 TIM44YIL022W 1296 nt10.27□□□□□ -0.77
NMD2P38798 CRC1YOR100C 984 nt10.27□□□□□ -0.77
NMD2P38798 RPN14YGL004C 1254 nt10.26□□□□□ -0.77
NMD2P38798 SPE2YOL052C 1191 nt10.26□□□□□ -0.77
NMD2P38798 SEN2YLR105C 1134 nt10.25□□□□□ -0.77
NMD2P38798 snR31snR31 225 nt10.25□□□□□ -0.77
NMD2P38798 THP3YPR045C 1413 nt10.24□□□□□ -0.77
NMD2P38798 IGD1YFR017C 588 nt10.24□□□□□ -0.77
NMD2P38798 RPC31YNL151C 756 nt10.24□□□□□ -0.77
NMD2P38798 KRE1YNL322C 942 nt10.24□□□□□ -0.77
NMD2P38798 LEU2YCL018W 1095 nt10.23□□□□□ -0.77
NMD2P38798 NAS6YGR232W 687 nt10.22□□□□□ -0.77
NMD2P38798 MDM35YKL053C-A 261 nt10.22□□□□□ -0.77
NMD2P38798 YKL053WYKL053W 375 nt10.22□□□□□ -0.77
NMD2P38798 RIM2YBR192W 1134 nt10.22□□□□□ -0.77
NMD2P38798 KRR1YCL059C 951 nt10.21□□□□□ -0.77
NMD2P38798 PSD1YNL169C 1503 nt10.21□□□□□ -0.78
NMD2P38798 NAM8YHR086W 1572 nt10.21□□□□□ -0.78
NMD2P38798 DPL1YDR294C 1770 nt10.2□□□□□ -0.78
NMD2P38798 FSH2YMR222C 672 nt10.2□□□□□ -0.78
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