Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2E2P29084 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2E2P29084 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2E2P29084 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2E2P29084 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2E2P29084 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2E2P29084 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2E2P29084 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2E2P29084 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2E2P29084 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2E2P29084 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2E2P29084 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2E2P29084 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2E2P29084 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2E2P29084 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2E2P29084 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2E2P29084 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2E2P29084 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2E2P29084 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2E2P29084 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2E2P29084 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2E2P29084 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2E2P29084 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2E2P29084 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2E2P29084 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2E2P29084 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2E2P29084 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2E2P29084 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2E2P29084 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2E2P29084 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2E2P29084 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2E2P29084 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2E2P29084 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2E2P29084 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2E2P29084 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2E2P29084 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2E2P29084 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2E2P29084 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2E2P29084 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2E2P29084 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2E2P29084 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2E2P29084 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2E2P29084 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2E2P29084 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2E2P29084 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2E2P29084 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2E2P29084 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2E2P29084 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2E2P29084 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2E2P29084 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2E2P29084 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2E2P29084 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2E2P29084 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2E2P29084 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2E2P29084 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2E2P29084 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2E2P29084 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2E2P29084 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2E2P29084 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2E2P29084 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2E2P29084 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2E2P29084 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2E2P29084 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2E2P29084 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2E2P29084 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2E2P29084 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2E2P29084 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2E2P29084 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2E2P29084 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2E2P29084 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2E2P29084 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2E2P29084 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2E2P29084 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2E2P29084 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2E2P29084 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E2P29084 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2E2P29084 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2E2P29084 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2E2P29084 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2E2P29084 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2E2P29084 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2E2P29084 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2E2P29084 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2E2P29084 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2E2P29084 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2E2P29084 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2E2P29084 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2E2P29084 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2E2P29084 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2E2P29084 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2E2P29084 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2E2P29084 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2E2P29084 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2E2P29084 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2E2P29084 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2E2P29084 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2E2P29084 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2E2P29084 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2E2P29084 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2E2P29084 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms