Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
DNMT1P26358 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
DNMT1P26358 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
DNMT1P26358 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
DNMT1P26358 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
DNMT1P26358 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
DNMT1P26358 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
DNMT1P26358 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
DNMT1P26358 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
DNMT1P26358 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
DNMT1P26358 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC40.09■■■■■ 4.01
DNMT1P26358 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
DNMT1P26358 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
DNMT1P26358 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
DNMT1P26358 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
DNMT1P26358 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
DNMT1P26358 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
DNMT1P26358 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
DNMT1P26358 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC40.05■■■■■ 4
DNMT1P26358 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
DNMT1P26358 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC40.03■■■■■ 4
DNMT1P26358 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
DNMT1P26358 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
DNMT1P26358 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
DNMT1P26358 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
DNMT1P26358 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
DNMT1P26358 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
DNMT1P26358 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
DNMT1P26358 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC39.97■■■■□ 3.99
DNMT1P26358 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
DNMT1P26358 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
DNMT1P26358 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
DNMT1P26358 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC39.97■■■■□ 3.99
DNMT1P26358 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
DNMT1P26358 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
DNMT1P26358 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
DNMT1P26358 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
DNMT1P26358 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
DNMT1P26358 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.99
DNMT1P26358 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
DNMT1P26358 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
DNMT1P26358 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
DNMT1P26358 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
DNMT1P26358 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
DNMT1P26358 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
DNMT1P26358 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
DNMT1P26358 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
DNMT1P26358 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
DNMT1P26358 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
DNMT1P26358 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
DNMT1P26358 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
DNMT1P26358 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.88■■■■□ 3.97
DNMT1P26358 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
DNMT1P26358 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC39.87■■■■□ 3.97
DNMT1P26358 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
DNMT1P26358 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
DNMT1P26358 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
DNMT1P26358 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
DNMT1P26358 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
DNMT1P26358 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
DNMT1P26358 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
DNMT1P26358 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
DNMT1P26358 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
DNMT1P26358 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
DNMT1P26358 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC39.78■■■■□ 3.96
DNMT1P26358 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
DNMT1P26358 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
DNMT1P26358 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
DNMT1P26358 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
DNMT1P26358 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
DNMT1P26358 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
DNMT1P26358 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
DNMT1P26358 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
DNMT1P26358 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
DNMT1P26358 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
DNMT1P26358 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
DNMT1P26358 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
DNMT1P26358 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
DNMT1P26358 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
DNMT1P26358 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
DNMT1P26358 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC39.71■■■■□ 3.95
DNMT1P26358 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
DNMT1P26358 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
DNMT1P26358 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
DNMT1P26358 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
DNMT1P26358 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
DNMT1P26358 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
DNMT1P26358 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
DNMT1P26358 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
DNMT1P26358 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
DNMT1P26358 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
DNMT1P26358 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
DNMT1P26358 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
DNMT1P26358 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
DNMT1P26358 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
DNMT1P26358 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
DNMT1P26358 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
DNMT1P26358 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
DNMT1P26358 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
DNMT1P26358 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms