Protein–RNA interactions for Protein: P21941

MATN1, Cartilage matrix protein, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN1P21941 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MATN1P21941 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MATN1P21941 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MATN1P21941 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MATN1P21941 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MATN1P21941 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MATN1P21941 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MATN1P21941 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MATN1P21941 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MATN1P21941 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MATN1P21941 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MATN1P21941 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MATN1P21941 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MATN1P21941 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MATN1P21941 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MATN1P21941 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MATN1P21941 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MATN1P21941 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MATN1P21941 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MATN1P21941 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MATN1P21941 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MATN1P21941 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MATN1P21941 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MATN1P21941 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MATN1P21941 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MATN1P21941 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MATN1P21941 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MATN1P21941 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MATN1P21941 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MATN1P21941 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MATN1P21941 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MATN1P21941 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MATN1P21941 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MATN1P21941 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MATN1P21941 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MATN1P21941 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MATN1P21941 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MATN1P21941 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MATN1P21941 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MATN1P21941 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MATN1P21941 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MATN1P21941 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MATN1P21941 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MATN1P21941 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MATN1P21941 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MATN1P21941 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MATN1P21941 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MATN1P21941 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MATN1P21941 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MATN1P21941 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MATN1P21941 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MATN1P21941 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MATN1P21941 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MATN1P21941 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MATN1P21941 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MATN1P21941 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MATN1P21941 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MATN1P21941 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MATN1P21941 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MATN1P21941 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MATN1P21941 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MATN1P21941 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MATN1P21941 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MATN1P21941 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MATN1P21941 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MATN1P21941 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MATN1P21941 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MATN1P21941 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MATN1P21941 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MATN1P21941 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MATN1P21941 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MATN1P21941 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MATN1P21941 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MATN1P21941 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MATN1P21941 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MATN1P21941 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MATN1P21941 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MATN1P21941 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MATN1P21941 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MATN1P21941 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MATN1P21941 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MATN1P21941 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MATN1P21941 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MATN1P21941 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MATN1P21941 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MATN1P21941 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MATN1P21941 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MATN1P21941 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MATN1P21941 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MATN1P21941 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MATN1P21941 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MATN1P21941 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MATN1P21941 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MATN1P21941 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MATN1P21941 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MATN1P21941 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MATN1P21941 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MATN1P21941 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MATN1P21941 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MATN1P21941 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms