Protein–RNA interactions for Protein: P01834

IGKC, Immunoglobulin kappa constant, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKCP01834 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGKCP01834 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGKCP01834 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGKCP01834 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IGKCP01834 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGKCP01834 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGKCP01834 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGKCP01834 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IGKCP01834 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGKCP01834 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGKCP01834 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGKCP01834 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
IGKCP01834 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGKCP01834 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGKCP01834 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGKCP01834 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGKCP01834 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGKCP01834 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGKCP01834 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGKCP01834 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGKCP01834 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGKCP01834 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGKCP01834 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGKCP01834 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGKCP01834 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGKCP01834 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGKCP01834 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGKCP01834 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGKCP01834 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IGKCP01834 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGKCP01834 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGKCP01834 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGKCP01834 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGKCP01834 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGKCP01834 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGKCP01834 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGKCP01834 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGKCP01834 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGKCP01834 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGKCP01834 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGKCP01834 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGKCP01834 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGKCP01834 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGKCP01834 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGKCP01834 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGKCP01834 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGKCP01834 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGKCP01834 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGKCP01834 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGKCP01834 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGKCP01834 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGKCP01834 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGKCP01834 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGKCP01834 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGKCP01834 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGKCP01834 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGKCP01834 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGKCP01834 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGKCP01834 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGKCP01834 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGKCP01834 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGKCP01834 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGKCP01834 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGKCP01834 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGKCP01834 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGKCP01834 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IGKCP01834 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGKCP01834 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGKCP01834 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGKCP01834 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGKCP01834 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGKCP01834 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGKCP01834 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGKCP01834 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGKCP01834 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGKCP01834 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGKCP01834 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGKCP01834 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGKCP01834 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGKCP01834 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGKCP01834 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGKCP01834 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IGKCP01834 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGKCP01834 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGKCP01834 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGKCP01834 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGKCP01834 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGKCP01834 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGKCP01834 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGKCP01834 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGKCP01834 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGKCP01834 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGKCP01834 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGKCP01834 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKCP01834 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKCP01834 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKCP01834 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKCP01834 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKCP01834 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKCP01834 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms