Protein–RNA interactions for Protein: O95967

EFEMP2, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP2O95967 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EFEMP2O95967 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EFEMP2O95967 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EFEMP2O95967 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EFEMP2O95967 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EFEMP2O95967 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EFEMP2O95967 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
EFEMP2O95967 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EFEMP2O95967 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EFEMP2O95967 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EFEMP2O95967 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EFEMP2O95967 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EFEMP2O95967 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EFEMP2O95967 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EFEMP2O95967 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EFEMP2O95967 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EFEMP2O95967 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EFEMP2O95967 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EFEMP2O95967 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EFEMP2O95967 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
EFEMP2O95967 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EFEMP2O95967 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EFEMP2O95967 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EFEMP2O95967 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EFEMP2O95967 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EFEMP2O95967 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EFEMP2O95967 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EFEMP2O95967 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EFEMP2O95967 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EFEMP2O95967 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EFEMP2O95967 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EFEMP2O95967 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EFEMP2O95967 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EFEMP2O95967 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EFEMP2O95967 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EFEMP2O95967 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EFEMP2O95967 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFEMP2O95967 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFEMP2O95967 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFEMP2O95967 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFEMP2O95967 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFEMP2O95967 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EFEMP2O95967 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EFEMP2O95967 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EFEMP2O95967 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EFEMP2O95967 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EFEMP2O95967 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EFEMP2O95967 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EFEMP2O95967 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EFEMP2O95967 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EFEMP2O95967 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFEMP2O95967 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFEMP2O95967 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EFEMP2O95967 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFEMP2O95967 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFEMP2O95967 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFEMP2O95967 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFEMP2O95967 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFEMP2O95967 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFEMP2O95967 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFEMP2O95967 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFEMP2O95967 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFEMP2O95967 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFEMP2O95967 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFEMP2O95967 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFEMP2O95967 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFEMP2O95967 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFEMP2O95967 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFEMP2O95967 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
EFEMP2O95967 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFEMP2O95967 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFEMP2O95967 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFEMP2O95967 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFEMP2O95967 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFEMP2O95967 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFEMP2O95967 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFEMP2O95967 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFEMP2O95967 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFEMP2O95967 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFEMP2O95967 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFEMP2O95967 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
EFEMP2O95967 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFEMP2O95967 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFEMP2O95967 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFEMP2O95967 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFEMP2O95967 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFEMP2O95967 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFEMP2O95967 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFEMP2O95967 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFEMP2O95967 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFEMP2O95967 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFEMP2O95967 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EFEMP2O95967 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
EFEMP2O95967 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EFEMP2O95967 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EFEMP2O95967 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EFEMP2O95967 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EFEMP2O95967 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EFEMP2O95967 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EFEMP2O95967 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms