Protein–RNA interactions for Protein: H7C350

CCDC188, Coiled-coil domain-containing protein 188, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC188H7C350 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC188H7C350 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC188H7C350 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC188H7C350 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC188H7C350 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC188H7C350 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC188H7C350 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC188H7C350 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC188H7C350 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC188H7C350 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC188H7C350 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC188H7C350 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC188H7C350 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC188H7C350 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC188H7C350 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC188H7C350 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC188H7C350 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC188H7C350 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC188H7C350 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC188H7C350 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC188H7C350 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC188H7C350 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC188H7C350 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC188H7C350 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC188H7C350 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC188H7C350 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC188H7C350 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC188H7C350 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC188H7C350 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC188H7C350 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC188H7C350 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC188H7C350 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC188H7C350 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC188H7C350 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC188H7C350 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC188H7C350 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC188H7C350 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC188H7C350 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC188H7C350 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC188H7C350 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC188H7C350 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC188H7C350 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC188H7C350 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC188H7C350 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC188H7C350 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC188H7C350 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC188H7C350 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC188H7C350 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC188H7C350 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC188H7C350 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC188H7C350 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC188H7C350 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC188H7C350 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC188H7C350 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC188H7C350 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC188H7C350 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC188H7C350 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC188H7C350 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC188H7C350 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC188H7C350 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC188H7C350 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC188H7C350 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC188H7C350 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC188H7C350 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC188H7C350 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC188H7C350 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC188H7C350 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC188H7C350 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC188H7C350 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC188H7C350 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC188H7C350 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC188H7C350 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC188H7C350 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC188H7C350 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC188H7C350 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC188H7C350 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC188H7C350 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC188H7C350 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC188H7C350 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC188H7C350 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC188H7C350 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC188H7C350 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC188H7C350 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC188H7C350 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC188H7C350 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC188H7C350 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC188H7C350 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC188H7C350 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC188H7C350 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC188H7C350 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC188H7C350 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC188H7C350 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC188H7C350 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC188H7C350 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC188H7C350 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC188H7C350 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC188H7C350 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC188H7C350 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC188H7C350 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC188H7C350 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms