Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
CROCC2H7BZ55 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC40.01■■■■■ 4
CROCC2H7BZ55 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC40■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC39.96■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CROCC2H7BZ55 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CROCC2H7BZ55 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CROCC2H7BZ55 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CROCC2H7BZ55 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
CROCC2H7BZ55 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CROCC2H7BZ55 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CROCC2H7BZ55 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CROCC2H7BZ55 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
CROCC2H7BZ55 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CROCC2H7BZ55 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CROCC2H7BZ55 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
CROCC2H7BZ55 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
CROCC2H7BZ55 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
CROCC2H7BZ55 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
CROCC2H7BZ55 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
CROCC2H7BZ55 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
CROCC2H7BZ55 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
CROCC2H7BZ55 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CROCC2H7BZ55 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
CROCC2H7BZ55 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
CROCC2H7BZ55 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
CROCC2H7BZ55 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
CROCC2H7BZ55 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.96
CROCC2H7BZ55 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
CROCC2H7BZ55 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
CROCC2H7BZ55 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CROCC2H7BZ55 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CROCC2H7BZ55 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CROCC2H7BZ55 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
CROCC2H7BZ55 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
CROCC2H7BZ55 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
CROCC2H7BZ55 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
CROCC2H7BZ55 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC39.76■■■■□ 3.96
CROCC2H7BZ55 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
CROCC2H7BZ55 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
CROCC2H7BZ55 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
CROCC2H7BZ55 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC39.66■■■■□ 3.94
CROCC2H7BZ55 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
CROCC2H7BZ55 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
CROCC2H7BZ55 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
CROCC2H7BZ55 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
CROCC2H7BZ55 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
CROCC2H7BZ55 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
CROCC2H7BZ55 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
CROCC2H7BZ55 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
CROCC2H7BZ55 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
CROCC2H7BZ55 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
CROCC2H7BZ55 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.92
CROCC2H7BZ55 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
CROCC2H7BZ55 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
CROCC2H7BZ55 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
CROCC2H7BZ55 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
CROCC2H7BZ55 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
CROCC2H7BZ55 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CROCC2H7BZ55 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CROCC2H7BZ55 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
CROCC2H7BZ55 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CROCC2H7BZ55 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CROCC2H7BZ55 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
CROCC2H7BZ55 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms