Protein–RNA interactions for Protein: E5RHQ5

NPIPB11, Nuclear pore complex-interacting protein family member B11, humanhuman

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB11E5RHQ5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPIPB11E5RHQ5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPIPB11E5RHQ5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPIPB11E5RHQ5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPIPB11E5RHQ5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPIPB11E5RHQ5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPIPB11E5RHQ5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPIPB11E5RHQ5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPIPB11E5RHQ5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPB11E5RHQ5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPB11E5RHQ5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPB11E5RHQ5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPB11E5RHQ5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPB11E5RHQ5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPB11E5RHQ5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPB11E5RHQ5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NPIPB11E5RHQ5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NPIPB11E5RHQ5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPB11E5RHQ5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPB11E5RHQ5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPB11E5RHQ5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPIPB11E5RHQ5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPIPB11E5RHQ5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPIPB11E5RHQ5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPB11E5RHQ5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPB11E5RHQ5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPB11E5RHQ5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPB11E5RHQ5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPB11E5RHQ5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPB11E5RHQ5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPB11E5RHQ5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPB11E5RHQ5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPB11E5RHQ5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPIPB11E5RHQ5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NPIPB11E5RHQ5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPIPB11E5RHQ5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPIPB11E5RHQ5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPIPB11E5RHQ5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NPIPB11E5RHQ5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
NPIPB11E5RHQ5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPB11E5RHQ5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPB11E5RHQ5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPB11E5RHQ5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPB11E5RHQ5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPB11E5RHQ5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPB11E5RHQ5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPB11E5RHQ5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPB11E5RHQ5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPIPB11E5RHQ5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPIPB11E5RHQ5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPIPB11E5RHQ5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NPIPB11E5RHQ5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPIPB11E5RHQ5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPIPB11E5RHQ5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPIPB11E5RHQ5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPIPB11E5RHQ5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPIPB11E5RHQ5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPIPB11E5RHQ5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPIPB11E5RHQ5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NPIPB11E5RHQ5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPIPB11E5RHQ5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPIPB11E5RHQ5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPIPB11E5RHQ5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPIPB11E5RHQ5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPIPB11E5RHQ5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPIPB11E5RHQ5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPIPB11E5RHQ5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPIPB11E5RHQ5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPIPB11E5RHQ5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPIPB11E5RHQ5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPIPB11E5RHQ5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPB11E5RHQ5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPB11E5RHQ5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPB11E5RHQ5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPB11E5RHQ5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPIPB11E5RHQ5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPIPB11E5RHQ5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPIPB11E5RHQ5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPIPB11E5RHQ5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPIPB11E5RHQ5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPIPB11E5RHQ5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPIPB11E5RHQ5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPIPB11E5RHQ5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPIPB11E5RHQ5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPIPB11E5RHQ5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPIPB11E5RHQ5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPIPB11E5RHQ5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPIPB11E5RHQ5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPIPB11E5RHQ5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPIPB11E5RHQ5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPIPB11E5RHQ5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPIPB11E5RHQ5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPIPB11E5RHQ5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPIPB11E5RHQ5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPIPB11E5RHQ5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPIPB11E5RHQ5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB11E5RHQ5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB11E5RHQ5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB11E5RHQ5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NPIPB11E5RHQ5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms