Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CCDC144AA2RUR9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CCDC144AA2RUR9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CCDC144AA2RUR9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CCDC144AA2RUR9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CCDC144AA2RUR9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CCDC144AA2RUR9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CCDC144AA2RUR9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CCDC144AA2RUR9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
CCDC144AA2RUR9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CCDC144AA2RUR9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CCDC144AA2RUR9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CCDC144AA2RUR9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CCDC144AA2RUR9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CCDC144AA2RUR9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CCDC144AA2RUR9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CCDC144AA2RUR9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CCDC144AA2RUR9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CCDC144AA2RUR9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CCDC144AA2RUR9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CCDC144AA2RUR9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
CCDC144AA2RUR9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
CCDC144AA2RUR9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CCDC144AA2RUR9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CCDC144AA2RUR9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CCDC144AA2RUR9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CCDC144AA2RUR9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CCDC144AA2RUR9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
CCDC144AA2RUR9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
CCDC144AA2RUR9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
CCDC144AA2RUR9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
CCDC144AA2RUR9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CCDC144AA2RUR9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CCDC144AA2RUR9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
CCDC144AA2RUR9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CCDC144AA2RUR9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CCDC144AA2RUR9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
CCDC144AA2RUR9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
CCDC144AA2RUR9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CCDC144AA2RUR9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CCDC144AA2RUR9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CCDC144AA2RUR9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CCDC144AA2RUR9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CCDC144AA2RUR9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CCDC144AA2RUR9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CCDC144AA2RUR9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CCDC144AA2RUR9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
CCDC144AA2RUR9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CCDC144AA2RUR9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CCDC144AA2RUR9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
CCDC144AA2RUR9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CCDC144AA2RUR9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CCDC144AA2RUR9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
CCDC144AA2RUR9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CCDC144AA2RUR9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CCDC144AA2RUR9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CCDC144AA2RUR9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CCDC144AA2RUR9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CCDC144AA2RUR9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CCDC144AA2RUR9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CCDC144AA2RUR9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CCDC144AA2RUR9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CCDC144AA2RUR9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CCDC144AA2RUR9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CCDC144AA2RUR9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CCDC144AA2RUR9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CCDC144AA2RUR9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CCDC144AA2RUR9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CCDC144AA2RUR9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CCDC144AA2RUR9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CCDC144AA2RUR9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CCDC144AA2RUR9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CCDC144AA2RUR9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CCDC144AA2RUR9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CCDC144AA2RUR9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CCDC144AA2RUR9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.69
CCDC144AA2RUR9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
CCDC144AA2RUR9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
CCDC144AA2RUR9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CCDC144AA2RUR9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CCDC144AA2RUR9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CCDC144AA2RUR9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CCDC144AA2RUR9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CCDC144AA2RUR9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CCDC144AA2RUR9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
CCDC144AA2RUR9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CCDC144AA2RUR9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
CCDC144AA2RUR9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
CCDC144AA2RUR9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
CCDC144AA2RUR9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
CCDC144AA2RUR9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
CCDC144AA2RUR9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
CCDC144AA2RUR9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
CCDC144AA2RUR9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
CCDC144AA2RUR9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
CCDC144AA2RUR9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CCDC144AA2RUR9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CCDC144AA2RUR9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CCDC144AA2RUR9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
CCDC144AA2RUR9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms