Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTW7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTW7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A1B0GTW7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A1B0GTW7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
A0A1B0GTW7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
A0A1B0GTW7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A1B0GTW7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A1B0GTW7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A1B0GTW7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A1B0GTW7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A1B0GTW7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A1B0GTW7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A1B0GTW7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A1B0GTW7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A1B0GTW7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A1B0GTW7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A1B0GTW7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A1B0GTW7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
A0A1B0GTW7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A1B0GTW7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A1B0GTW7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A1B0GTW7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A1B0GTW7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A1B0GTW7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A1B0GTW7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A1B0GTW7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A1B0GTW7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A1B0GTW7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A1B0GTW7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A1B0GTW7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A1B0GTW7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A1B0GTW7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A1B0GTW7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A1B0GTW7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms