Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A1Q9Y2Q0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms